致癌驱动基因与炎症微环境决定肝脏肿瘤表型
数据可用于分析致癌驱动基因与炎症微环境如何共同决定肝脏肿瘤表型，以及腺瘤向癌转化和肿瘤生长的相关转录特征（来源 BioStudies）
基本信息
资源简介
致癌驱动基因与炎症微环境决定肝脏肿瘤表型
Oncogenic driver genes and the inflammatory microenvironment dictate liver tumor phenotype
该数据集来自 ebi.ac.uk，属于肿瘤/肝癌分类，主题为 transcription profiling by array，物种为 Mus musculus。研究通过组成性激活的 AKT-1（AKT）与 b-catenin（CAT）在小鼠中诱导肝脏肿瘤，并用 3,5-diethoxycarbonyl-1,4-dihydrocollidine（DDC）和四氯化碳（CCl4）诱导慢性肝脏炎症，同时比较 AKT-CAT 与 AKT-NRASG12V 两种肝肿瘤模型中 DDC 诱导炎症的影响。数据可用于分析致癌驱动基因与炎症微环境如何共同决定肝脏肿瘤表型，以及腺瘤向癌转化和肿瘤生长的相关转录特征（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：大多数肝细胞癌（HCC）发生在由病毒性肝炎和酒精性或非酒精性脂肪性肝炎引起的慢性肝脏炎症背景之下。然而，不同类型的慢性炎症微环境对由不同致癌基因产生的肿瘤表型的影响在很大程度上尚未明确。为解决这一问题，我们通过组成性激活的 AKT-1（AKT）和 b-catenin（CAT）生成小鼠肝脏肿瘤，随后通过 3,5-diethoxycarbonyl-1,4-dihydrocollidine（DDC）和四氯化碳（CCl4）诱导慢性肝脏炎症。此外，我们还比较了 DDC 诱导的慢性肝脏炎症在两种肝肿瘤模型（联合使用 AKT-CAT 或 AKT-NRASG12V）中的影响。DDC 和 CCl4 处理显著促进了腺瘤向癌的转化，并加速了 AKT-CAT 肿瘤的生长。此外，DDC 处理
【主题与分类】
主题标签：transcription profiling by array、Mus musculus。本站分类：肿瘤/肝癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-77503
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- OpenDataLab:
数据说明
E-GEOD-77503 致癌驱动基因与炎症微环境决定肝肿瘤表型的转录谱分析，采用芯片技术 EFO EFO_0002768 小鼠 大多数肝细胞癌（HCC）发生在由病毒性肝炎引起的慢性肝脏炎症背景下
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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