肝细胞癌无标记定量蛋白质组学数据揭示差异表达蛋白
该数据集包含肝细胞癌（HCC）与配对癌旁非肿瘤肝组织的无标记定量蛋白质组学处理结果。文件包括通过统计分析得到的差异表达显著蛋白
基本信息
资源简介
肝细胞癌无标记定量蛋白质组学数据揭示差异表达蛋白
该数据集为肝细胞癌（HCC）的无标记定量蛋白质组学处理结果，涵盖肿瘤组织与配对癌旁非肿瘤肝组织的差异表达显著蛋白。数据集英文名称为“Label-Free Quantitative Proteomics Data of Hepatocellular Carcinoma Revealing Differentially Expressed Proteins”，在站内归类于肿瘤/肝癌方向，来源站为doi.org，由Ilyas, Amber、Abedin, Qurat与von Kriegsheim, Alex共同完成，机构信息指向Zenodo，发布时间为2026年，采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可。整体而言，该数据集面向肝癌蛋白质组学研究，提供经统计分析获得的差异表达显著蛋白结果，可用于探索HCC与癌旁组织之间的蛋白表达变化。
【数据集背景】
肝细胞癌是常见的恶性肿瘤之一，对其肿瘤组织与配对癌旁非肿瘤肝组织进行蛋白质组学比较，有助于揭示疾病相关的蛋白表达改变。该数据集来源于一项经机构生物伦理委员会批准的研究，批准编号为IBC #352-2023，批准机构为卡拉奇大学机构生物伦理委员会。研究对象为肝细胞癌患者，纳入标准为年龄超过40岁、性别不限；所有参与者在样本采集前均签署知情同意书，并通过结构化访谈收集人口学信息、疾病史与治疗详情。研究排除了同时诊断为肝硬化或除HCC以外任何恶性肿瘤的患者。上述背景信息为理解该数据集的样本来源与伦理合规性提供了依据。
【数据内容】
该数据集包含肝细胞癌与配对癌旁非肿瘤肝组织的无标记定量蛋白质组学处理结果。文件内容包括通过统计分析得到的差异表达显著蛋白。数据集英文名称明确指向“揭示差异表达蛋白”的目标，因此其核心内容为差异表达显著蛋白的列表或相关处理结果。关于具体蛋白数量、表达倍数、显著性阈值、统计方法细节等，源站未提供。数据集不包含原始质谱数据或未处理的定量矩阵，源站描述仅提及“处理后的无标记定量蛋白质组学结果”以及“差异表达显著蛋白”。
【采集与来源】
样本为肿瘤组织与配对的癌旁非肿瘤肝组织，共n=6，通过手术切除方式取自当地医院。研究纳入肝细胞癌患者，年龄超过40岁，性别不限。样本采集前获得所有参与者的知情同意，并通过结构化访谈收集人口学信息、疾病史和治疗详情。排除标准为同时诊断为肝硬化或除HCC以外的任何恶性肿瘤。研究经卡拉奇大学机构生物伦理委员会批准，批准编号为IBC #352-2023。数据来源站为doi.org，机构信息为Zenodo。关于当地医院的具体名称、地理位置、样本采集时间范围等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肝细胞癌蛋白质组学的差异表达分析场景，可用于识别HCC肿瘤组织与配对癌旁非肿瘤肝组织之间显著差异表达的蛋白。潜在应用包括：作为肝癌生物标志物研究的候选蛋白来源；用于比较不同研究中HCC相关蛋白表达变化；支持功能富集分析或通路分析的输入；也可用于方法学比较或作为无标记定量蛋白质组学处理流程的示例数据。由于数据集提供的是处理后的差异表达显著蛋白结果，其更适合作为下游分析或验证研究的起点，而非原始数据再处理。关于具体适用疾病亚型、临床分期或治疗反应预测等场景，源站未提供。
【使用方法】
使用者可根据Creative Commons Attribution 4.0 International许可获取并使用该数据集。由于数据集包含处理后的无标记定量蛋白质组学结果与差异表达显著蛋白，使用时可将其作为差异表达蛋白列表进行下游分析，例如与其它组学数据整合、进行通路或功能注释、筛选候选标志物等。使用时应遵循许可要求，适当引用作者与数据集。关于文件格式、字段含义、数据表结构、是否附带分析代码或元数据说明等，源站未提供。因此，具体读取与解析方式需依据实际获取的文件内容确定。
【质量与限制】
该研究经机构生物伦理委员会批准，并取得参与者知情同意，样本纳入与排除标准明确，样本量为n=6对肿瘤与癌旁组织。数据集提供的是经过统计分析的差异表达显著蛋白，而非原始质谱数据或完整定量矩阵。限制方面：源站未提供具体统计方法、显著性阈值、归一化策略、缺失值处理方式、蛋白鉴定数量、差异倍数范围等信息；也未提供样本的临床分期、病理分级、病因背景、治疗状态等详细临床注释。此外，样本来自当地医院，但具体医院信息未提供，可能影响外部可重复性与泛化能力评估。使用者应结合自身研究目的谨慎解释差异表达结果。
【引用与许可】
该数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可，允许在署名条件下共享与改编。引用时应注明作者Ilyas, Amber、Abedin, Qurat与von Kriegsheim, Alex，数据集英文名称“Label-Free Quantitative Proteomics Data of Hepatocellular Carcinoma Revealing Differentially Expressed Proteins”，机构Zenodo，发布时间2026，以及来源站doi.org。关于具体DOI、引用格式、版本信息等，源站未提供。使用该数据集时，应遵守许可条款，并尊重研究伦理与参与者隐私。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.21350528
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 57.7 KB。
数据说明
该数据集包含肝细胞癌（HCC）及配对癌旁非肿瘤肝组织的无标记定量蛋白质组学处理结果。文件包括通过统计分析获得的差异表达显著蛋白质。本研究经卡拉奇大学生物伦理委员会批准（IBC #352-2023）。参与者包括任何性别的肝细胞癌（HCC）患者，年龄超过40岁。在样本采集前获得了所有参与者的知情同意，并进行了结构化访谈以收集人口统计学信息、疾病史和治疗详情。合并诊断为肝硬化或除HCC以外的任何恶性肿瘤的患者被排除在研究之外。肿瘤及配对癌旁非肿瘤肝组织（n=6）通过手术切除从卡拉奇的当地医院获得。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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