E-GEOD-65485:中国肝细胞癌中HBV-MLL4整合及其分子基础的新一代测序鉴定
数据通过新一代测序技术,用于鉴定中国肝细胞癌中HBV-MLL4整合事件并探究其分子基础。数据覆盖肝细胞癌样本中HBV整合相关表达差异,可用于分析病毒整合与宿主基因表达的关系,支持肝癌分子机制研究及潜在标志物发现(来源 ebi.ac.uk)

基本信息
资源简介
E-GEOD-65485:中国肝细胞癌中HBV-MLL4整合及其分子基础的新一代测序鉴定
E-GEOD-65485 是一个以肝细胞癌为研究对象的表达谱实验数据集,全称为“Next Generation Sequencing Identification of HBV-MLL4 integration and its molecular basis in Chinese hepatocellular carcinoma”。该数据集来源于 ebi.ac.uk,在分类上归属于肿瘤 / 肝癌方向,主题标签为 Differential,属于 Expression Atlas 中的差异表达实验。其核心内容围绕中国肝细胞癌样本,利用新一代测序技术鉴定 HBV-MLL4 整合事件,并探究这一整合现象的分子基础。数据集覆盖了肝细胞癌样本中与 HBV 整合相关的表达差异信息,可用于分析病毒整合与宿主基因表达之间的关系,为肝癌分子机制研究以及潜在标志物发现提供数据支持。
【数据集背景】
肝细胞癌是常见的恶性肿瘤类型之一,其发生发展涉及多种分子机制。在中国肝细胞癌患者中,乙型肝炎病毒(HBV)感染是重要的致病因素之一,病毒整合入宿主基因组的过程可能与肿瘤发生密切相关。E-GEOD-65485 正是针对这一背景设立的研究数据集,其英文名称明确指向“中国肝细胞癌中 HBV-MLL4 整合的新一代测序鉴定及其分子基础”。该数据集在来源站 ebi.ac.uk 中被标注为 Expression Atlas experiment(Differential),物种为 Homo sapiens,说明其属于人类差异表达实验数据,服务于肝癌相关分子机制的研究需求。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Differential,表明其内容侧重于差异表达分析。根据源站描述,该实验通过新一代测序技术,鉴定中国肝细胞癌中 HBV-MLL4 整合事件,并探究其分子基础。数据覆盖肝细胞癌样本中 HBV 整合相关的表达差异,可用于分析病毒整合与宿主基因表达的关系。数据集整体围绕 HBV-MLL4 整合这一核心事件展开,涉及肝细胞癌样本中的表达差异信息,支持肝癌分子机制研究及潜在标志物发现。除上述信息外,源站未提供更细粒度的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk,属于 Expression Atlas 中的差异表达实验。物种为 Homo sapiens。其英文名称表明研究聚焦于中国肝细胞癌,并采用新一代测序技术进行鉴定。源站描述中提及“Next Generation Sequencing Identification of HBV-MLL4 integration and its molecular basis in Chinese hepatocellular carcinoma”,说明数据采集依托新一代测序手段,样本背景为中国肝细胞癌。关于具体的样本数量、采集地点、时间跨度、测序平台型号等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肝细胞癌分子机制相关研究,尤其是围绕 HBV 整合与宿主基因表达关系的分析。由于主题标签为 Differential,可用于差异表达层面的探索,例如比较肝细胞癌样本中与 HBV 整合相关的表达变化。其潜在应用包括支持肝癌分子机制研究以及潜在标志物发现。此外,对于关注中国肝细胞癌人群、HBV-MLL4 整合事件的研究者,该数据集可作为新一代测序鉴定结果的参考来源。具体分析场景需结合源站提供的实验设计信息,源站未提供更详细的适用条件说明。
【使用方法】
该数据集来源于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas,属于差异表达实验。使用者可通过来源站获取该实验的相关数据。由于源站描述仅说明其为 Expression Atlas experiment(Differential),未提供具体的数据格式、下载方式、分析流程或软件工具建议,因此关于如何具体使用该数据集,源站未提供。使用者应依据来源站的实际数据页面进行访问与操作。
【质量与限制】
该数据集为 Expression Atlas 中的差异表达实验,物种为 Homo sapiens,来源站为 ebi.ac.uk。其英文名称和源站描述均指向中国肝细胞癌中 HBV-MLL4 整合的新一代测序鉴定。关于数据质量评估指标、样本量、重复数、测序深度、覆盖度、统计阈值等具体质量参数,源站未提供。因此,无法依据现有信息对该数据集的质量水平作出进一步判断。使用者在应用时应注意源站未提供相关质量控制细节这一限制。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk,属于 Expression Atlas 实验数据。关于该数据集的具体引用方式、许可协议、使用条款或授权信息,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时,应参考来源站 ebi.ac.uk 上的实际说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-65485
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Next Generation Sequencing Identification of HBV-MLL4 integration and its molecular basis in Chinese hepatocellular carcinoma
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




