慢性淋巴细胞白血病全外显子组测序
来自稳定期或进展期疾病患者的人类慢性淋巴细胞白血病样本的转录谱分析 [数据集]。主题标签:肿瘤、白血病、慢性淋巴细胞白血病、全外显子组测序、E-GEOD-10138

基本信息
资源简介
慢性淋巴细胞白血病全外显子组测序
本数据集为慢性淋巴细胞白血病全外显子测序数据,英文名称为 Whole Exome Sequencing of Chronic Lymphocytic Leukemia,在站内分类中归属于肿瘤 / 白血病方向。该数据集来源于 ebi.ac.uk,其源站描述指向 Daphne Friedman 于 2009 年发布的一项关于人类慢性淋巴细胞白血病样本的转录谱分析研究,数据编号为 E-GEOD-10138。从侧写线索来看,该数据集聚焦于来自稳定期或进展期疾病患者的人类慢性淋巴细胞白血病样本,主题标签涵盖肿瘤、白血病、慢性淋巴细胞白血病、全外显子组测序以及 E-GEOD-10138。整体而言,该数据集围绕慢性淋巴细胞白血病这一血液系统恶性肿瘤,提供了与疾病状态相关的组学数据资源,可用于理解稳定期与进展期患者样本在分子层面的特征差异。
【数据集背景】
慢性淋巴细胞白血病是一种常见的成人白血病类型,其临床病程具有高度异质性,部分患者长期处于稳定期,而另一些患者则表现为进展期疾病。该数据集所对应的研究关注稳定期与进展期疾病患者的人类慢性淋巴细胞白血病样本,试图通过转录谱分析刻画不同疾病状态下的分子特征。数据集名称强调全外显子测序,同时源站描述提及转录谱分析,二者共同指向对慢性淋巴细胞白血病样本进行的高通量分子层面检测。该数据集由 Daphne Friedman 于 2009 年发布,数据编号为 E-GEOD-10138,来源站为 ebi.ac.uk,站内分类为肿瘤 / 白血病。
【数据内容】
该数据集的主题标签包括肿瘤、白血病、慢性淋巴细胞白血病、全外显子组测序以及 E-GEOD-10138。其短描述为:来自稳定期或进展期疾病患者的人类慢性淋巴细胞白血病样本的转录谱分析。由此可知,数据集内容涉及人类慢性淋巴细胞白血病样本,样本来源覆盖稳定期与进展期两类疾病状态,检测层面涉及全外显子测序与转录谱分析。关于具体的样本数量、测序深度、覆盖度、变异位点数目、基因表达量矩阵或临床注释字段等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,源站描述为 Daphne Friedman (2009). Transcription profiling of human chronic lymphocytic leukemia samples from patients with stable or progressive disease [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-10138/。据此可知,数据由 Daphne Friedman 于 2009 年发布,原始页面位于 EBI 的 ArrayExpress 平台,实验编号为 E-GEOD-10138。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、患者纳入与排除标准、样本处理流程等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与慢性淋巴细胞白血病相关的分子特征研究,尤其是围绕稳定期与进展期疾病状态差异的探索。由于涉及全外显子测序与转录谱分析,潜在应用方向包括:比较不同疾病状态样本的分子图谱、识别与疾病进展相关的候选特征、作为慢性淋巴细胞白血病组学研究的参考数据资源,以及用于方法学验证或与其他组学数据整合分析的场景。关于该数据集是否适用于临床诊断、预后判断或治疗指导等具体用途,源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 获取,原始页面为 https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-10138/。使用者可依据该页面提供的下载方式与文件组织方式进行数据获取。关于具体的文件格式、数据处理流程、分析工具推荐、参考基因组版本、标准化方法或代码示例等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集由 Daphne Friedman 于 2009 年发布,来源站为 ebi.ac.uk,数据编号为 E-GEOD-10138。关于数据质量评估指标、样本完整性、测序质量分数、批次效应、缺失值比例、技术重复或验证实验等信息,源站未提供。使用者应注意,该数据集发布年份较早,其具体技术平台与处理流程需以源站页面说明为准。关于该数据集在临床或转化研究中的适用边界,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用信息为:Daphne Friedman (2009). Transcription profiling of human chronic lymphocytic leukemia samples from patients with stable or progressive disease [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-10138/。关于该数据集的许可条款、使用限制、商业用途规定或再分发条件等,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-10138
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Daphne Friedman (2009). Transcription profiling of human chronic lymphocytic leukemia samples from patients with stable or progressive disease [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-10138/
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