TMRM分选高低线粒体膜电位MLL-AF9白血病细胞RNA-seq数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23307986

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含一项关于MLL-AF9驱动的小鼠急性髓系白血病（AML）中线粒体膜电位（MMP）异质性的研究中的RNA-seq处理后数据。通过TMRM染色和荧光激活细胞分选（FACS），从YFP+ AML细胞中分离出低MMP和高MMP的白血病细胞，并使用Illumina配对末端RNA测序（PE150）对转录组进行了分析。样本 组织 MMP状态 小鼠配对 H8 骨髓 高 #8 L8 骨髓 低 #8 H14 脾脏 高 #14 L14 脾脏 低 #14 H17 脾脏 高 #17 L17 脾脏 低 #17 mRNA_read.count.txt —— 原始基因水平读取计数（Ensembl基因ID x 6个样本）mRNAexpression.TPM.xls —— 基因水平TPM值（含基因符号）数据处理：由测序服务提供商（2023年）：使用fastp进行接头修剪和质量控制；使用STAR比对到小鼠参考基因组（mm10）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。