CLL患者接受ibrutinib治疗的单细胞RNA-seq分析R数据包
该数据集为R数据包,来源于一项针对接受ibrutinib治疗的慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者外周血单个核细胞(PBMC)的单细胞RNA测序研究

基本信息
资源简介
CLL患者接受ibrutinib治疗的单细胞RNA-seq分析R数据包
R data package for Single-cell RNA-seq analysis reveals distinct tumor and immunosuppressive T-cell phenotypes in CLL patients treated with ibrutinib.
该数据集为R数据包,来源于一项针对接受ibrutinib治疗的慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者外周血单个核细胞(PBMC)的单细胞RNA测序研究。研究旨在揭示ibrutinib敏感与耐药CLL细胞及免疫微环境的差异,以探索控制残留病灶的新治疗策略。数据包含B细胞簇内独特的转录异质性信息,可用于分析CLL细胞异质性、免疫抑制性T细胞表型及药物敏感性相关机制。文件数量为1,格式为tar.gz压缩包(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2026-01-08。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):Bruton酪氨酸激酶抑制剂(BTKi)的开发及其进入临床实践代表了慢性淋巴细胞白血病(CLL)治疗的一大进步。然而,即使延长治疗,单用ibrutinib或其他BTKi通常也不能诱导完全缓解或不可检测的微小残留病(MRD)。因此,需要了解ibrutinib敏感和耐药CLL细胞之间的差异以及免疫微环境,以确定在BTKi治疗期间控制残留病灶的新治疗方法。在此,我们使用单细胞RNA测序研究了接受ibrutinib治疗的CLL患者外周血单个核细胞的细胞异质性。我们在ibrutinib敏感和耐药患者的B细胞簇中鉴定出独特的转录异质性。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 951.28 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.30758744.v1。
【主题与分类】
源站学科分类:Biochemistry and cell biology not elsewhere classified。主题标签:CLL、BTK、Ibrutinib。本站分类:肿瘤/白血病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biochemistry and cell biology not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/R_data_package_for_Single-cell_RNA-seq_analysis_reveals_distinct_tumor_and_immunosuppressive_T-cell_phenotypes_in_CLL_patients_treated_with_ibrutinib_/30758744
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Blaser, Brad (2026). R data package for Single-cell RNA-seq analysis reveals distinct tumor and immunosuppressive T-cell phenotypes in CLL patients treated with ibrutinib.. figshare. Dataset
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源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.30758744.v1
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 951.3 MB。
数据说明
Bruton酪氨酸激酶抑制剂(BTKi)的开发及其进入临床实践,代表了慢性淋巴细胞白血病(CLL)治疗领域的重大进展。然而,无论是依鲁替尼还是其他BTKi的单药治疗,即便延长疗程,通常也无法诱导完全缓解或达到不可检测的微小残留病(MRD)。因此,有必要深入了解依鲁替尼敏感与耐药CLL细胞之间的差异以及免疫微环境,以寻找在BTKi治疗期间控制残留疾病的新治疗策略。在此,我们采用单细胞RNA测序技术,对接受依鲁替尼治疗的CLL患者外周血单核细胞的细胞异质性进行了研究。我们在依鲁替尼敏感和耐药患者的B细胞群中鉴定出独特的转录异质性。依鲁替尼敏感细胞显示出B细胞群体的富集,伴有MHC I类分子和TNF家族成员的上调。
此外,我们观察到在依鲁替尼耐药样本中,炎症反应和代谢相关通路减少,而细胞应激反应和DNA修复程序增加。依鲁替尼耐药患者中的T细胞显示Treg扩增和耗竭的CD8效应T细胞区室。此外,来自依鲁替尼耐药患者的CD14+和CD16+单核细胞优先表达抗病毒免疫的基因表达程序。在单细胞水平上,我们的发现展示了肿瘤区室和免疫微环境中转录异质性的图景。总体而言,这些发现突出了与依鲁替尼耐药相关的循环免疫细胞中的转录变化,表明T细胞耗竭和单核细胞极化伴随而非直接驱动长期BTKi治疗期间的耐药。该数据集设计用于与一个分析项目一起使用,该项目可在github上找到。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




