CLL患者接受ibrutinib治疗的单细胞RNA-seq分析R数据包

该数据集为R数据包,来源于一项针对接受ibrutinib治疗的慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者外周血单个核细胞(PBMC)的单细胞RNA测序研究

figsharefigshare
datacite
2026-01-08 更新
浏览 11
基因组分类CLLBTKIbrutinib
R data package for Single-cell RNA-seq analysis reveals distinct tumor and immunosuppressive T-cell phenotypes in CLL patients treated with ibrutinib.

基本信息

模态
基因组
大小
0.951275533 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2026-01-08
版本
v1

资源简介

CLL患者接受ibrutinib治疗的单细胞RNA-seq分析R数据包

R data package for Single-cell RNA-seq analysis reveals distinct tumor and immunosuppressive T-cell phenotypes in CLL patients treated with ibrutinib.

该数据集为R数据包,来源于一项针对接受ibrutinib治疗的慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者外周血单个核细胞(PBMC)的单细胞RNA测序研究。研究旨在揭示ibrutinib敏感与耐药CLL细胞及免疫微环境的差异,以探索控制残留病灶的新治疗策略。数据包含B细胞簇内独特的转录异质性信息,可用于分析CLL细胞异质性、免疫抑制性T细胞表型及药物敏感性相关机制。文件数量为1,格式为tar.gz压缩包(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026-01-08。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Bruton酪氨酸激酶抑制剂(BTKi)的开发及其进入临床实践代表了慢性淋巴细胞白血病(CLL)治疗的一大进步。然而,即使延长治疗,单用ibrutinib或其他BTKi通常也不能诱导完全缓解或不可检测的微小残留病(MRD)。因此,需要了解ibrutinib敏感和耐药CLL细胞之间的差异以及免疫微环境,以确定在BTKi治疗期间控制残留病灶的新治疗方法。在此,我们使用单细胞RNA测序研究了接受ibrutinib治疗的CLL患者外周血单个核细胞的细胞异质性。我们在ibrutinib敏感和耐药患者的B细胞簇中鉴定出独特的转录异质性。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 951.28 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.30758744.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Biochemistry and cell biology not elsewhere classified。主题标签:CLL、BTK、Ibrutinib。本站分类:肿瘤/白血病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biochemistry and cell biology not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/R_data_package_for_Single-cell_RNA-seq_analysis_reveals_distinct_tumor_and_immunosuppressive_T-cell_phenotypes_in_CLL_patients_treated_with_ibrutinib_/30758744

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Blaser, Brad (2026). R data package for Single-cell RNA-seq analysis reveals distinct tumor and immunosuppressive T-cell phenotypes in CLL patients treated with ibrutinib.. figshare. Dataset

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.30758744.v1

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 951.3 MB。

数据说明

Bruton酪氨酸激酶抑制剂(BTKi)的开发及其进入临床实践,代表了慢性淋巴细胞白血病(CLL)治疗领域的重大进展。然而,无论是依鲁替尼还是其他BTKi的单药治疗,即便延长疗程,通常也无法诱导完全缓解或达到不可检测的微小残留病(MRD)。因此,有必要深入了解依鲁替尼敏感与耐药CLL细胞之间的差异以及免疫微环境,以寻找在BTKi治疗期间控制残留疾病的新治疗策略。在此,我们采用单细胞RNA测序技术,对接受依鲁替尼治疗的CLL患者外周血单核细胞的细胞异质性进行了研究。我们在依鲁替尼敏感和耐药患者的B细胞群中鉴定出独特的转录异质性。依鲁替尼敏感细胞显示出B细胞群体的富集,伴有MHC I类分子和TNF家族成员的上调。

此外,我们观察到在依鲁替尼耐药样本中,炎症反应和代谢相关通路减少,而细胞应激反应和DNA修复程序增加。依鲁替尼耐药患者中的T细胞显示Treg扩增和耗竭的CD8效应T细胞区室。此外,来自依鲁替尼耐药患者的CD14+和CD16+单核细胞优先表达抗病毒免疫的基因表达程序。在单细胞水平上,我们的发现展示了肿瘤区室和免疫微环境中转录异质性的图景。总体而言,这些发现突出了与依鲁替尼耐药相关的循环免疫细胞中的转录变化,表明T细胞耗竭和单核细胞极化伴随而非直接驱动长期BTKi治疗期间的耐药。该数据集设计用于与一个分析项目一起使用,该项目可在github上找到。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。