PRJNA89525：TARGET 急性髓系白血病（AML）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA89525

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

TARGET AML数据集包含200多例经全面表征的急性髓系白血病（AML）患者病例（均为肿瘤/正常配对样本，其中100例还配有复发样本），每例均具备基因表达、肿瘤与配对正常样本的拷贝数分析、甲基化以及全面的下一代测序数据，包括全基因组测序、mRNA-seq和miRNA-seq。其中一部分病例还将提供全外显子组测序数据。此外，还有大量病例具有部分分子特征描述，使该数据集成为一个规模庞大且信息丰富的基因组数据集。此外，TARGET AML队列还包含一些高度侵袭性的亚型，包括AML“诱导失败”病例。确诊后，无高危遗传标志物的AML患者接受标准化疗，称为primary……（更多内容见dbGaP研究页面。）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。