PRJNA89519：TARGET 急性淋巴细胞白血病（ALL）I 期试点
该数据集来自 TARGET 项目的急性淋巴细胞白血病（ALL）I 期试点，包含 189 例完整表征患者病例，每例均有基因表达、肿瘤与配对正常样本拷贝数分析以及至少一种测序数据；另有 230 例具备部分分子表征和/或测序数据，涵盖全基因组测序、mRNA-seq 和/或 kinome 测序
基本信息
资源简介
PRJNA89519：TARGET 急性淋巴细胞白血病（ALL）I 期试点
PRJNA89519 对应 TARGET 项目下的急性淋巴细胞白血病（ALL）I 期试点数据集，属于肿瘤/白血病分类，来源为 ncbi.nlm.nih.gov。该试点阶段纳入 189 例经过完整表征的患者病例，每例均具备基因表达数据、肿瘤与配对正常样本的拷贝数分析，以及至少一种测序数据（Sanger 测序和/或下一代测序）。此外还有 230 例病例具备部分分子表征和/或测序数据，涉及全基因组测序、mRNA-seq 和/或 kinome 测序。该数据集以表型或基因型为主题标签，为急性淋巴细胞白血病的分子层面研究提供了多组学资料。
【数据集背景】
该数据集是 TARGET 项目急性淋巴细胞白血病研究的 I 期试点部分。TARGET 是一项基因组学研究计划，本试点旨在对儿童急性淋巴细胞白血病病例进行分子层面的系统表征。源站说明，有关本项目及其他 TARGET 基因组学项目的更多信息，可访问 TARGET 网站 https://www.cancer.gov/ccg/research/genome-sequencing/target 获取；关于任何 TARGET 子研究数据共享的最新细节，可参见 TARGET 出版物指南。
【数据内容】
数据集由两部分病例构成。第一部分为 189 例完整表征的患者病例，构成试点的核心，每例均包含基因表达数据、肿瘤与配对正常样本的拷贝数分析，以及至少一种类型的测序数据，测序类型为 Sanger 测序和/或下一代测序。第二部分为 230 例具备部分分子表征和/或测序数据的病例，涵盖全基因组测序、mRNA-seq 和/或 kinome 测序。两部分合计覆盖了从完整多组学表征到部分分子数据的多个层次。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，属于 TARGET 项目急性淋巴细胞白血病 I 期试点的公开数据资源。源站未提供具体的样本采集地点、采集时间、患者招募标准及伦理审批信息。
【适用场景】
该数据集适用于急性淋巴细胞白血病的分子特征研究，包括基因表达分析、肿瘤与配对正常样本的拷贝数比较，以及基于 Sanger 测序、下一代测序、全基因组测序、mRNA-seq 和 kinome 测序等多种测序手段的变异与表达探索。其主题标签为表型或基因型，可用于关联分子数据与疾病表型的研究。源站未提供其他具体应用场景的说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用说明、数据下载格式、文件组织方式或分析流程。源站仅提示可访问 TARGET 网站了解项目信息，并参见 TARGET 出版物指南获取数据共享的最新细节。
【质量与限制】
数据集的病例构成明确：189 例为完整表征，230 例为部分分子表征和/或测序数据，后者在数据完整性上不及前者。源站未提供关于数据准确性、缺失率、批次效应或质控标准的具体信息。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式与许可条款。源站提及 TARGET 出版物指南可用于了解 TARGET 子研究数据共享的最新细节，但未给出具体的许可类型或使用限制。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA89519
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
TARGET ALL数据集的试点阶段（I期）由189例经过全面特征分析的患者病例组成，每例均具备基因表达、肿瘤及配对正常样本的拷贝数分析数据，以及至少一种测序（Sanger和/或下一代测序）数据。另有230例病例具有部分分子特征分析和/或测序数据，包括全基因组测序、mRNA-seq和/或激酶组测序。请访问TARGET网站https://www.cancer.gov/ccg/research/genome-sequencing/target，获取有关该项目及其他TARGET基因组学项目的更多信息。有关任何TARGET子研究数据共享的最新详情，请参阅TARGET出版指南。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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