PRJNA862202:儿童急性髓系白血病靶向测序分析

该数据集来自 NCBI,为儿童急性髓系白血病(AML)的靶向基因组测序数据,主题标签为 Raw sequence reads,属于肿瘤/白血病分类

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA862202: Targeted Sequencing Analysis of Pediatric Acute Myeloid Leukemia

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA862202:儿童急性髓系白血病靶向测序分析

PRJNA862202 是一个面向儿童急性髓系白血病(AML)的靶向基因组测序数据集,来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov)。该研究旨在为儿童急性髓系白血病患者生成一份靶向基因组数据集,所产生的数据以原始测序读长(Raw sequence reads)的形式组织,在本站归入肿瘤 / 白血病分类。该数据集的核心价值在于将测序分析聚焦于儿童 AML 这一特定疾病背景下的目标基因组区域,为后续围绕该疾病的研究者提供可直接获取的原始序列数据基础。以下从数据集背景、数据内容、采集与来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集对应的研究目标是生成一套针对儿童急性髓系白血病的靶向基因组数据集。急性髓系白血病是儿童血液系统恶性肿瘤中的重要类型,围绕其开展基因组层面的测序分析有助于在分子水平上刻画该疾病的特征。与全基因组测序不同,靶向测序将测序范围限定在预先选定的目标区域,从而以更有针对性的方式获取与研究目的相关的序列信息。该数据集正是这一研究思路下的产物,其定位明确指向儿童 AML 的靶向测序分析,而非泛化的肿瘤测序数据集合。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Raw sequence reads,即数据主体为测序产生的原始序列读长。这意味着数据以测序仪输出的原始读长形式存在,尚未经过比对、变异识别等下游处理步骤,保留了测序过程最原始的信息形态。数据集英文名称中明确包含“Targeted Sequencing Analysis”,表明这些原始读长来自靶向测序实验,而非全基因组或全转录组测序。关于样本数量、测序平台、目标区域的具体基因列表、读长长度、数据总量等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI,即美国国家生物技术信息中心,其站点为 ncbi.nlm.nih.gov。数据由相关研究产生并提交至该公共数据库,供后续检索与使用。研究本身的目的是为儿童急性髓系白血病构建靶向基因组数据集。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、测序服务机构等具体采集环节的信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其儿童 AML 靶向测序原始读长的属性,该数据集适用于围绕儿童急性髓系白血病开展的基因组学研究,例如对目标区域进行序列比对、变异筛查、候选位点验证,或作为方法学研究中靶向测序数据分析流程的输入数据。由于数据为原始读长,也可用于重新处理与再分析,以适配不同的分析策略。关于该数据集在具体研究中的已验证应用案例或推荐分析流程,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,通常需要先从 NCBI 获取原始测序读长文件,再依据靶向测序的目标区域信息进行比对与后续分析。由于数据以 Raw sequence reads 形式提供,使用者需自行完成质量控制、比对、变异识别等步骤。关于该数据集的具体下载路径、文件组织方式、是否附带目标区域文件或分析配置文件等操作层面的细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为靶向测序数据,其覆盖范围限于研究设定的目标区域,不能等同于全基因组层面的信息,因此不适用于目标区域之外的基因组分析。数据以原始读长形式提供,未包含经过整理与注释的变异结果,使用者需自行承担数据处理与质量控制的工作。关于该数据集的具体质量评估指标、测序深度、覆盖均一性、样本纳入排除标准等信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI,使用时应遵循该数据库的相关使用与引用规范。关于该数据集的具体引用文献、作者列表、发表刊物以及数据许可条款等细节,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA862202

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This study aimed to generate a targeted genomic dataset for children with acute myeloid leukemia

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