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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA722042：年轻与老年急性髓细胞白血病患者血小板转录组RNA测序表征

PRJNA722042 是一项围绕急性髓细胞白血病患者血小板转录组展开的RNA测序数据集，英文全称为“Characterization of the platelet transcriptome by RNA sequencing in young and elderly patients with acute myelocytic leukemia”。该数据集由NCBI（ncbi.nlm.nih.gov）收录，归类于肿瘤／白血病方向，主题标签为原始测序读段（Raw sequence reads）。数据集共包含17份血液血小板样本的RNA测序数据，按照患者年龄分为两组：7份来自60岁以下的急性髓细胞白血病患者，10份来自60岁以上的急性髓细胞白血病患者。其核心目标是通过RNA测序刻画不同年龄组急性髓细胞白血病患者的血小板转录组特征，为理解年龄因素与白血病患者血小板基因表达谱之间的关系提供原始测序层面的数据基础。

【数据集背景】

急性髓细胞白血病是一种累及髓系造血细胞的恶性血液肿瘤，患者常伴随血小板数量与功能异常。血小板虽然本身无细胞核，但仍携带源自巨核细胞的RNA分子，其转录本组成可在一定程度上反映造血微环境与疾病状态的变化。年龄是急性髓细胞白血病临床特征与预后差异的重要影响因素之一，老年患者与年轻患者在疾病表现和治疗反应上往往存在差别。该数据集正是针对这一背景，尝试通过RNA测序手段比较不同年龄组患者血小板的转录组轮廓，从而为相关研究提供可用的测序数据资源。

【数据内容】

数据集的主体是17份血液血小板样本的RNA测序数据，数据形式为原始测序读段。样本按年龄划分为两组：60岁以下急性髓细胞白血病患者来源的血小板样本7份，60岁以上急性髓细胞白血病患者来源的血小板样本10份。两组样本数量不等，老年组样本量相对更多。数据内容聚焦于血小板转录组，即这些样本中RNA分子的测序读段信息，可用于后续的转录本比对、表达定量与差异分析等处理。除上述样本构成与数据类型的描述外，源站未提供更细化的测序平台、读长、数据量等参数信息。

【采集与来源】

该数据集来源于NCBI，源站地址为ncbi.nlm.nih.gov，属于公开可获取的序列数据资源。样本采集对象为急性髓细胞白血病患者，采集材料为血液血小板，并按患者年龄是否达到60岁进行分组。数据由原始测序读段构成，主题标签明确标注为Raw sequence reads。关于样本采集的具体机构、采集时间、伦理审批信息以及测序服务的具体提供方，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于血小板转录组相关的研究场景，尤其是需要比较不同年龄组急性髓细胞白血病患者血小板基因表达特征的分析工作。典型用途包括：对原始读段进行质量控制与预处理，开展转录本比对与表达水平定量，进而在年轻组与老年组之间进行差异表达分析、功能富集分析或转录组轮廓比较；也可作为白血病血小板RNA测序方法学研究的参考数据，或用于与其他血液系统疾病血小板转录组数据的对照分析。由于数据为原始测序读段，使用者的分析空间较大，可根据研究目的选择不同的比对与定量流程。

【使用方法】

使用该数据集时，通常先从NCBI获取原始测序读段文件，随后进行测序质量评估与低质量读段过滤，再依据所选参考基因组与注释文件完成比对和转录本定量，最后结合样本分组信息开展组间比较。由于数据集包含两个年龄组的样本，分析时应明确各样本的组别归属，注意两组样本量不一致可能对统计检验的影响。对于血小板RNA测序数据，还需关注血小板样本中可能存在的微量其他细胞来源RNA的干扰，并在分析流程中采取相应的过滤或校正策略。具体的下载路径、文件命名规则与分析参数，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的样本总量为17份，其中年轻组7份、老年组10份，样本规模相对有限，组间样本量不平衡，可能影响差异分析结果的稳健性。数据仅覆盖血小板转录组，不包含其他血液细胞类型或临床表型信息，因而难以直接支持更广泛的机制推断。源站未提供测序深度、读段长度、数据质量评分、样本处理细节及临床元数据等关键信息，使用者在解读结果时需充分考虑这些限制。此外，数据集未提供独立验证队列或技术重复信息，相关结论的普适性有待进一步研究确认。

【引用与许可】

该数据集收录于NCBI，源站为ncbi.nlm.nih.gov。关于数据的具体引用方式、作者信息、发表文献以及使用许可条款，源站未提供。使用者在下载与使用数据前，应自行查阅NCBI页面上的相关说明并遵守其数据使用政策。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA722042

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA722042

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们报告了17份血小板样本的RNA测序数据，其中包括7份采集自60岁以下急性髓细胞白血病患者的血小板样本，以及10份采集自60岁以上急性髓细胞白血病患者的血小板样本。该数据集旨在刻画不同年龄急性髓细胞白血病患者的血小板转录组图谱。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别