PRJNA438542：NSD2组蛋白甲基转移酶激活突变驱动急性淋巴细胞白血病致癌重编程
该数据集来自NCBI，属于肿瘤/白血病类别，主题标签为Raw sequence reads。源站描述指出NSD2的E1099K突变导致H3K36二甲基化增加，激活致癌基因表达程序；NSD2突变细胞获得多种恶性表型并增强对小鼠脑实质的侵袭
基本信息
资源简介
PRJNA438542：NSD2组蛋白甲基转移酶激活突变驱动急性淋巴细胞白血病致癌重编程
PRJNA438542 数据集来自 NCBI，归类于肿瘤/白血病方向，主题标签为 Raw sequence reads。该数据集围绕 NSD2 组蛋白甲基转移酶的 E1099K 激活突变展开，源站描述指出该突变导致 H3K36 二甲基化水平升高，进而激活致癌基因表达程序；携带 NSD2 突变的细胞可获得多种恶性表型，并表现出对小鼠脑实质侵袭能力的增强。通过对异常表达基因和通路的识别，该数据集为 NSD2 失调相关恶性肿瘤的治疗干预研究提供了线索。整体而言，该数据集属于以原始测序读段为核心内容的肿瘤/白血病研究资源，适合用于探索 NSD2 突变驱动的转录与表观遗传重编程机制。
【数据集背景】
急性淋巴细胞白血病（ALL）是一种血液系统恶性肿瘤。组蛋白甲基转移酶 NSD2 的异常与肿瘤发生发展密切相关。源站描述明确指出，NSD2 的 E1099K 突变是一种激活型突变，可导致 H3K36 二甲基化增加，从而激活致癌基因表达程序。NSD2 突变细胞由此获得多种恶性表型，并增强对小鼠脑实质的侵袭能力。识别这些异常表达的基因和通路，被认为有助于为 NSD2 失调相关恶性肿瘤寻找治疗干预途径。该数据集正是在这一研究背景下产生，聚焦于 NSD2 突变驱动的致癌重编程。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，即原始测序读段，说明其核心数据形式为测序产生的原始读段数据。源站描述提及对异常表达基因和通路的识别，表明数据可用于基因表达层面的分析。除上述信息外，关于样本数量、测序平台、读段长度、文件格式与数据规模等具体细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，数据集英文名称为“PRJNA438542: An Activating Mutation of the NSD2 Histone Methyltransferase Drives Oncogenic Reprogramming in Acute Lymphocytic Leukemia”。本站将其归类为肿瘤/白血病。关于样本采集的具体组织类型、供体信息、采集时间与地点等，源站未提供。
【适用场景】
基于源站描述，该数据集适用于研究 NSD2 E1099K 突变引起的 H3K36 二甲基化变化及其对致癌基因表达程序的激活作用；可用于识别 NSD2 突变细胞中异常表达的基因与通路；也可用于探讨 NSD2 突变细胞恶性表型及对小鼠脑实质侵袭增强的相关分子机制。此外，该数据集可为 NSD2 失调相关恶性肿瘤的治疗干预研究提供数据基础。关于其他具体应用场景，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以原始测序读段为内容，通常需要经过读段质控、比对或定量等处理后方可用于表达与通路分析。关于该数据集的具体处理流程、推荐分析工具与参数设置，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI，主题标签为 Raw sequence reads。关于数据质量评估指标、批次效应、样本代表性及潜在偏倚等具体信息，源站未提供。使用时应注意其研究范围聚焦于 NSD2 E1099K 突变相关的急性淋巴细胞白血病模型，结论外推需谨慎。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA438542
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
NSD2的E1099K突变导致H3K36二甲基化水平升高，从而激活致癌基因表达程序。NSD2突变细胞获得多种恶性表型，并表现出对小鼠脑实质侵袭能力增强。识别异常表达的基因和通路为NSD2失调恶性肿瘤的治疗干预提供了途径。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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