基本信息

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基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA285278：CLL8队列临床测序全外显子组测序

PRJNA285278 是一个围绕 CLL8 队列开展临床测序的项目，其核心内容是针对该队列样本进行全外显子组测序。该项目以 Homo sapiens 为研究对象，在 NCBI 的 BioProject 数据库中登记，编号为 285278。从分类上看，它归属于肿瘤与白血病方向，主题标签涉及 Phenotype or Genotype，说明项目关注的重点与表型或基因型相关。BioProject 作为生物数据的集合记录，旨在将同一项计划下产生的多种数据类型汇聚到统一入口，方便使用者查找并建立数据之间的关联。对于希望了解 CLL8 队列全外显子组测序数据的研究者而言，该记录提供了一个可定位、可追溯的项目级入口，有助于从整体上把握该测序计划的范围与数据组织方式。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，项目英文名称为 Clinical Sequencing: Whole Exome Sequencing of CLL8 Cohort。BioProject 的设立目的，是将源自单一机构或联合体、围绕同一项研究计划产生的生物数据进行集中管理。一个 BioProject 记录为用户提供单一入口，用以发现该项目所生成的不同数据类型之间的链接。本项目聚焦于 CLL8 队列，属于临床测序范畴，并以全外显子组测序作为主要技术路线。其分类落在肿瘤 / 白血病方向，主题标签为 Phenotype or Genotype，表明项目在数据组织上兼顾表型与基因型两个维度。

【数据内容】

项目名明确指向全外显子组测序，研究对象为人。数据内容围绕 CLL8 队列的临床测序展开，属于肿瘤与白血病相关领域。BioProject 记录本身并不等同于原始测序数据文件，而是将同一计划下产生的多种数据类型汇聚于一处，便于查找与关联。除上述信息外，关于样本数量、测序深度、覆盖范围、变异类型、具体数据文件格式与规模等，源站未提供。

【采集与来源】

数据登记于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 数据库，项目编号为 285278，物种标注为 Homo sapiens。项目由单一计划发起，BioProject 记录用于汇集该计划下产生的多种数据类型。关于样本采集地点、采集时间、机构名称、伦理审批信息以及具体的测序平台与建库方法等，源站未提供。

【适用场景】

基于项目名称与分类，该数据集适用于与 CLL8 队列相关的全外显子组测序研究场景，尤其是需要从项目层面查找和关联多种数据类型的用途。主题标签涉及 Phenotype or Genotype，提示其可用于表型与基因型关联方向的探索。由于分类为肿瘤 / 白血病，也可服务于白血病相关研究中对项目级数据入口的检索需求。关于具体的分析应用、临床决策支持或药物靶点发现等，源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 285278 或项目名称进行检索，进入该记录后利用其提供的链接查找同一计划下生成的不同数据类型。BioProject 的设计即在于提供单一入口，以便发现并关联项目内的多样数据。关于具体的下载方式、数据格式转换、分析流程或配套工具，源站未提供。

【质量与限制】

该记录为 BioProject 项目级条目，其作用在于汇集与链接数据，而非直接呈现测序数据本身。因此，使用时应结合项目内实际链接的数据类型来评估适用性。关于数据质量指标、覆盖度、样本完整性、批次效应或验证情况等，源站未提供。

【引用与许可】

项目登记于 NCBI BioProject，编号 285278，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用格式、许可条款、使用限制或数据共享政策等，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA285278

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA285278

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对原发肿瘤样本进行大规模全外显子组测序（WES），能够无偏倚地发现复发性推定驱动事件及克隆演化模式。我们通过对538例慢性淋巴细胞白血病（CLL）及其匹配的种系DNA进行WES，报告了44个复发性突变基因和11个复发性CNV的鉴定结果。这些包括先前未被认识的癌症驱动基因（如RPS15、IKZF3），并共同确定了核输出、MYC活性和MAPK信号通路是CLL体细胞突变影响的核心通路。对该大型数据集的克隆性分析进一步使得这些驱动事件之间的时间关系得以重建。在280例收集于……之前的样本中，若干驱动因素与较短的无进展生存期（PFS）相关。（更多内容请参见dbGaP研究页面。）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别