基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1517640：Jurkat细胞中人类TERT转录本5'区新型可变剪接变体的鉴定与表征

该数据集为 NCBI BioProject 收录的一项生物学研究项目，编号 1517640，英文名称为“Identification and characterization of novel alternative splice variants in the 5' region of human TERT transcript in Jurkat cells”。从名称可以看出，该项目聚焦于人类 TERT 转录本 5' 区域，在 Jurkat 细胞背景下寻找并刻画此前未被识别的可变剪接变体。按本站分类，该数据集归入肿瘤 / 白血病方向，主题标签为“Raw sequence reads”，说明其核心数据形态为原始测序读长。整体而言，这是一个以转录本结构解析为目标、以测序数据为支撑的 BioProject 记录，适合关注端粒酶逆转录酶（TERT）转录调控、可变剪接以及白血病细胞模型的研究者参考。

【数据集背景】

TERT 基因编码端粒酶逆转录酶，其转录本 5' 区域的结构变化可能影响转录起始、剪接调控及最终蛋白产物。Jurkat 细胞是研究白血病与 T 细胞相关分子机制的常用细胞模型。该项目以 Jurkat 细胞为实验体系，针对人类 TERT 转录本 5' 区开展新型可变剪接变体的鉴定与表征，属于肿瘤 / 白血病研究范畴。源站将其登记为 BioProject，意味着它并非单一实验的零散结果，而是一个围绕特定研究目标组织起来的生物数据集合。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其包含的数据类型以原始序列读长为主。项目名称指向“鉴定与表征”两类工作：一方面发现 5' 区的新型可变剪接变体，另一方面对这些变体进行特征描述。除上述信息外，关于具体样本数量、测序平台、读长长度、变体数目、表达水平或验证实验结果等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 数据库，源站标题为“ID 1517640 - BioProject - NCBI”。BioProject 的定位是汇集与某一项研究计划相关的生物数据，这些数据可来自单一机构或联合体；一条 BioProject 记录为用户提供统一入口，以便找到该项目所产生的多种数据类型。该数据集即属于此类记录，其原始数据与相关链接可通过该 BioProject 编号在 NCBI 中定位。关于样本采集地点、时间、伦理审批及具体实验流程，源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于围绕人类 TERT 转录本 5' 区可变剪接开展的分析工作，例如在白血病相关细胞模型中考察剪接变体的存在与结构特征。由于主题标签为原始序列读长，它也可能适合作为转录本组装、剪接位点识别或读长比对分析的输入数据。对于研究 TERT 转录调控与肿瘤 / 白血病分子机制的科研人员，该 BioProject 可作为数据检索与再利用的入口。需要说明的是，上述适用方向基于项目名称与主题标签所反映的研究主题，具体分析可行性仍取决于数据本身的质量与覆盖范围。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI BioProject 记录编号 1517640 访问该项目的统一入口，并经由该入口查找与其关联的多种数据类型。由于该记录的主题标签为“Raw sequence reads”，使用时可优先关注原始测序读长相关数据。关于具体的下载方式、文件格式、分析流程或推荐工具，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集登记于 NCBI BioProject，具备统一的项目记录入口，便于发现和关联该项目产生的数据。其主题标签为“Raw sequence reads”，提示数据以原始读长形式存在，通常需要后续处理才能用于剪接变体的判定。关于数据质量指标、测序深度、重复次数、污染评估、样本量及统计效力等，源站未提供。此外，项目名称限定于 Jurkat 细胞中人类 TERT 转录本 5' 区，其结论外推至其他细胞类型或其它基因区域时应保持谨慎。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI BioProject，源站标题为“ID 1517640 - BioProject - NCBI”。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用限制或数据共享政策，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1517640

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1517640

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

人类TERT基因编码端粒酶的催化亚基，该基因经历广泛的替代剪接，产生多种转录异构体，这些异构体在端粒维持、细胞衰老和癌症进展中具有不同甚至相反的功能。然而，该基因5’区域——特别是外显子1-4及其邻近的大型内含子序列——的替代剪接模式在很大程度上仍未被探索。本研究的主要目标是利用高通量下一代测序技术，在Jurkat T细胞白血病模型中全面编目并表征人TERT转录本外显子2和外显子4之间出现的新型剪接变体。我们的方法使得鉴定出16种不同的剪接变体成为可能，其中包括13种此前未报道的异构体，其中许多源于内含子2内隐蔽假外显子的激活。这项工作的重要性在于它有助于更深入地理解TERT表达的调控复杂性。

通过揭示TERT 5’端异常剪接事件的多样性，本研究为未来探究非经典异构体如何影响TERT的端粒酶非依赖性功能、促进癌症中的剪接失调，以及可能作为恶性肿瘤的生物标志物或治疗靶点奠定了基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别