PRJNA1466055：THP-1巨噬细胞miRNA-seq WT与LAMP2A KO对比

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PRJNA1466055：THP-1巨噬细胞miRNA-seq WT与LAMP2A KO对比

PRJNA1466055 是一个针对 THP-1 人单核细胞白血病细胞来源巨噬细胞的微小 RNA 测序（miRNA-seq）数据集，用于比较野生型（WT）与 LAMP2A 敲除（KO）两种基因型在缺氧条件下的小 RNA 表达情况。研究首先用佛波酯（PMA）将 THP-1 单核细胞诱导分化为巨噬细胞样细胞，随后构建小 RNA 文库并测序，获得原始 miRNA reads，为两种基因型之间的差异表达分析提供原始数据基础。该数据集归属于肿瘤/白血病分类，主题标签为原始序列读段（Raw sequence reads），来源为 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov）。

【数据集背景】

该数据集围绕 LAMP2A 在巨噬细胞缺氧条件下对微小 RNA 调控的作用展开。研究以 THP-1 人单核细胞白血病细胞为细胞模型，先经 PMA 诱导分化为巨噬细胞样细胞，再对野生型与 LAMP2A 敲除两种基因型进行比较。这一设计旨在从 miRNA 层面观察 LAMP2A 缺失在缺氧环境中所引起的调控变化，为理解该基因在巨噬细胞小 RNA 调控网络中的功能提供测序数据支撑。

【数据内容】

数据集内容为小 RNA 测序产生的原始 miRNA reads。样本覆盖两种基因型：野生型（WT）与 LAMP2A 敲除（KO），均在缺氧条件下培养。数据以原始序列读段形式提供，可用于后续的 miRNA 差异表达分析，比较 WT 与 KO 之间的小 RNA 表达差异。数据主题标签为原始序列读段。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov。实验流程为：THP-1 人单核细胞白血病细胞经 PMA（phorbol 12-myristate 13-acetate）诱导分化为巨噬细胞样细胞；随后对野生型与 LAMP2A 敲除两种基因型在缺氧条件下构建小 RNA 文库并进行测序。测序产生的小 RNA 原始 reads 构成本数据集的主体内容。

【适用场景】

该数据集适用于在缺氧条件下比较 THP-1 来源巨噬细胞中野生型与 LAMP2A 敲除型 miRNA 表达差异的研究场景，可用于 miRNA 差异表达分析，并为进一步探究 LAMP2A 在巨噬细胞微小 RNA 调控中的作用提供原始数据。其白血病细胞背景也使其可用于肿瘤/白血病相关的基础研究语境。

【使用方法】

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【质量与限制】

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【引用与许可】

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