PRJNA1458280：AML 自噬基因 panel

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PRJNA1458280：AML 自噬基因 panel

PRJNA1458280（AML autophagy gene-panel）是一个面向急性髓系白血病（AML）研究的靶向 RNA 测序数据集，收录于 NCBI 站点。该数据集包含 50 例人类样本的测序数据，样本构成包括 33 例确诊为急性髓系白血病的患者以及 17 例健康供者。研究采用自行设计的定制 panel，靶向 33 个基因，这些基因主要参与自噬过程及与 AML 相关的通路。数据集以原始序列读段（Raw sequence reads）的形式提供，属于肿瘤/白血病分类下的转录组测序资源，可用于比较 AML 患者与健康供者在自噬相关基因表达层面的差异。

【数据集背景】

急性髓系白血病是一种起源于髓系造血干/祖细胞的恶性血液肿瘤，其发生发展与细胞内多种通路异常密切相关，自噬是其中受到关注的方向之一。为在转录水平上考察自噬及 AML 相关通路中特定基因的表现，该研究设计了针对 33 个基因的定制靶向测序 panel，并据此对临床样本与健康对照样本开展靶向 RNA 测序。数据集即为该研究产生的原始测序读段集合，其设计目标聚焦于自噬相关基因及 AML 相关通路基因的靶向捕获与定量分析，而非全转录组范围的广泛扫描。

【数据内容】

数据集包含 50 例人类样本的靶向 RNA 测序数据，其中 33 例来自急性髓系白血病患者，17 例来自健康供者。测序对象为研究定制的 33 个基因 panel，这些基因主要涉及自噬及 AML 相关通路。数据以原始序列读段形式组织，属于原始测序数据层级，未提供经过比对、定量或差异分析后的加工结果说明。样本分组信息（患者与健康供者）构成了该数据集进行病例对照比较的基础结构。

【采集与来源】

数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，编号为 PRJNA1458280。样本为人类来源，包括 AML 患者与健康供者两类。关于样本采集的具体机构、采集时间、伦理审批信息以及测序平台与试剂版本等细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于围绕急性髓系白血病与自噬相关基因开展的研究场景，例如：对 33 个 panel 基因在 AML 患者与健康供者之间进行表达层面的比较分析；针对自噬通路及 AML 相关通路基因的靶向表达验证；作为 AML 转录组研究中特定基因集合的原始数据来源，用于重新比对、定量或与其他队列的联合分析。由于数据为靶向 panel 测序而非全转录组测序，其适用范围限于 panel 所覆盖的 33 个基因，不宜外推至全基因组或全转录组水平的结论。

【使用方法】

使用者可从 NCBI 获取该项目的原始序列读段，按照靶向 RNA 测序的常规流程进行质量控制、比对与基因水平定量，并结合样本分组信息（33 例 AML 患者与 17 例健康供者）开展病例对照比较。分析时应以 panel 覆盖的 33 个自噬及 AML 相关通路基因为核心关注对象。关于具体的比对参考、定量工具与参数设置，源站未提供，需使用者根据数据特点自行确定。

【质量与限制】

该数据集为靶向 panel 测序数据，仅覆盖 33 个基因，无法支持对全转录组或 panel 之外基因的推断。样本总量为 50 例，其中患者 33 例、健康供者 17 例，组间样本量不完全均衡。数据以原始读段形式提供，未提供加工后的表达矩阵或分析结果。关于测序深度、读长、数据质量评分及批次信息等，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），项目编号为 PRJNA1458280。关于具体的引用文献、作者列表以及数据使用许可条款，源站未提供，使用者在引用与再利用前应查阅源站相应页面予以确认。