PRJNA1456817:应用CRISPR/Cas9基因编辑技术鉴定海防急性白血病致病基因研究

该数据集来自NCBI,包含三株源自越南急性白血病患者原始细胞的自然永生化细胞系(AL035、AL040、AL045),分别对应AML、T-ALL及MDS(CMML)

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1456817: Research on the application of CRISPR/Cas9 gene editing technology to identify genes causing acute leukemia in vitro in Hai Phong.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1456817:应用CRISPR/Cas9基因编辑技术鉴定海防急性白血病致病基因研究

该数据集来自NCBI,包含三株源自越南急性白血病患者原始细胞的自然永生化细胞系(AL035、AL040、AL045),分别对应AML、T-ALL及MDS(CMML)。细胞系在RPMI-1640加10% FBS中稳定维持,未经外源基因修饰或病毒转导。每株细胞系均完成WGS(30x以上)、WES(100x以上)、G显带核型分析(20个以上中期分裂相)、多色流式免疫表型及May-Grunwald-Giemsa形态学评估。数据可用于白血病分子与细胞遗传学特征研究及基因编辑靶点鉴定(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本项目对三株自然永生化急性白血病细胞系(AL035、AL040、AL045)进行了全面的分子和细胞遗传学表征,这些细胞系建立自被诊断为急性髓系白血病(AML)、T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)和MDS(CMML)的越南患者的原始细胞。这些细胞系在添加10% FBS的RPMI-1640中稳定维持,未经外源基因修饰或病毒转导。每株细胞系均通过全基因组测序(WGS,30x或以上)、全外显子测序(WES,100x或以上)、G显带核型分析(20个或以上中期分裂相)、多色流式细胞术免疫表型分析和按FAB/WHO标准的May-Grunwald-Giemsa形态学评估进行了全面表征。该数据集构成了首个来自越南患者白血病细胞系的全面表征生物样本库,提供了一个

【主题与分类】

主题标签:Raw sequence reads。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1456817

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目对三株自然永生化急性白血病细胞系(AL035、AL040、AL045)进行了全面的分子和细胞遗传学表征,这些细胞系分别建立自被诊断为急性髓系白血病(AML)、T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)和MDS(CMML)的越南患者原始细胞。这些细胞系在添加10% FBS的RPMI-1640培养基中稳定维持,未经过外源基因修饰或病毒转导。每株细胞系均通过全基因组测序(WGS,30x或以上)、全外显子组测序(WES,100x或以上)、G显带核型分析(20个或以上中期分裂相)、多色流式细胞术免疫表型分析以及依据FAB/WHO标准的May-Grunwald-Giemsa形态学评估进行了全面表征。该数据集构成了首个来自越南患者白血病细胞系的全面表征生物样本库,为个性化医学研究、药物筛选以及在特定遗传背景下的治疗靶点鉴定提供了基础。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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