PRJNA1233325：EYA1酪氨酸磷酸酶抑制——老药再利用治疗MLL重排白血病
该数据集来自NCBI，包含MLL重排急性白血病细胞系经苯溴马隆（BBR）处理后的RNA-seq原始测序数据。研究对MOLM-13、SEM和KOPN-8细胞以18-20 uM BBR处理24小时，分析转录变化以识别差异表达基因，揭示BBR在白血病细胞中的作用机制，为MLL重排白血病的新型治疗策略提供线
基本信息
资源简介
PRJNA1233325：EYA1酪氨酸磷酸酶抑制——老药再利用治疗MLL重排白血病
该数据集来自 NCBI，英文名称为 PRJNA1233325: EYA1 Tyrosine Phosphatase Inhibition using a Repurposed Drug as an Effective Treatment for MLL-Rearranged Leukemia，本站归类为肿瘤 / 白血病。数据集包含 MLL 重排急性白血病细胞系经苯溴马隆（BBR）处理后的 RNA-seq 原始测序数据。研究对 MOLM-13、SEM 和 KOPN-8 三种细胞系以 18–20 uM BBR 处理 24 小时，通过转录组测序分析转录变化并识别差异表达基因，以揭示 BBR 在白血病细胞中的作用机制，为 MLL 重排白血病的新型治疗策略提供线索。
【数据集背景】
MLL 重排急性白血病是一种侵袭性强、预后较差的血液系统恶性肿瘤，临床亟需新的治疗思路。该数据集对应的研究聚焦于 EYA1 酪氨酸磷酸酶抑制这一方向，探索将已上市药物苯溴马隆（BBR）重新定位用于 MLL 重排白血病治疗的可行性。研究以基因表达变化为切入点，考察 BBR 处理对 MLL 重排白血病细胞系转录组的影响，从而为理解该药物在白血病细胞中的作用机制、评估其作为新型治疗策略的潜力提供数据基础。
【数据内容】
数据集的主题标签为 Raw sequence reads，即原始测序读段数据。数据来自三种 MLL 重排白血病细胞系——MOLM-13、SEM 和 KOPN-8——在 18–20 uM 苯溴马隆处理 24 小时后的 RNA 测序（RNA-seq）。研究通过对处理后细胞转录变化的分析，识别差异表达基因，进而揭示 BBR 在白血病细胞中的作用机制。数据内容围绕药物处理后的转录组原始测序读段展开，可用于后续的基因表达定量与差异表达分析。
【采集与来源】
数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。实验对象为 MOLM-13、SEM 和 KOPN-8 三种 MLL 重排白血病细胞系；处理条件为 18–20 uM 苯溴马隆处理 24 小时；检测手段为 RNA 测序（RNA-seq），产出原始测序读段。关于测序平台、文库构建方式、重复设置、对照设计等具体实验细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于 MLL 重排急性白血病相关的基础与转化研究，尤其是围绕苯溴马隆（BBR）作用机制的研究。典型用途包括：对 BBR 处理前后白血病细胞系进行转录组比较、识别差异表达基因、分析药物处理引起的转录变化，以及为 MLL 重排白血病新型治疗策略的探索提供数据支撑。由于数据为原始测序读段，也可作为 RNA-seq 数据处理流程的输入材料，用于基因表达层面的二次分析。
【使用方法】
使用该数据集时，通常以原始测序读段为起点，经过读段质控、比对或定量等标准 RNA-seq 分析流程，获得各样本的基因表达水平，再在 MOLM-13、SEM 和 KOPN-8 细胞系中比较 BBR 处理 24 小时后的转录变化，识别差异表达基因并解释其生物学意义。具体的分析参数、参考基因组版本及推荐的流程细节，源站未提供。
【质量与限制】
数据集为原始测序读段，其质量评估依赖于后续的质控与分析流程。关于样本重复数、测序深度、测序平台、对照样本设置以及数据质控指标等信息，源站未提供。使用时应结合具体研究目的谨慎解释结果，注意数据仅涉及 MOLM-13、SEM 和 KOPN-8 三种细胞系及 18–20 uM BBR 处理 24 小时这一实验条件，结论外推需谨慎。
【引用与许可】
数据集的来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式、作者信息及许可条款，源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1233325
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
MLL重排急性白血病具有侵袭性强、预后差的特点，凸显了对新治疗方法的迫切需求。本研究采用RNA测序（RNA-seq）技术，探讨苯溴马隆（BBR）对MLL重排白血病细胞系基因表达的影响。用18 - 20 uM的BBR处理MOLM-13、SEM和KOPN-8细胞24小时，并分析转录变化以识别差异表达基因。该数据集为理解BBR在白血病细胞中的作用机制提供了见解，有助于认识针对MLL重排白血病的新型治疗策略。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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