PRJNA1094436:异基因造血细胞移植后经遗传免疫逃逸导致的白血病复发
该数据集来自 NCBI,主题为 Raw sequence reads,聚焦异基因造血细胞移植后白血病复发的遗传免疫逃逸机制

基本信息
资源简介
PRJNA1094436:异基因造血细胞移植后经遗传免疫逃逸导致的白血病复发
该数据集来自 NCBI,主题为 Raw sequence reads,聚焦异基因造血细胞移植后白血病复发的遗传免疫逃逸机制。源站描述指出,移植物抗白血病反应依赖供者 T 效应细胞识别白血病新抗原,而部分患者因免疫反应未能控制白血病生长而复发;广泛的免疫遗传学研究显示,种系与体细胞层面 HLA 异质性降低会提高白血病复发风险,种系编码的 II 类 HLA 基因型低进化分歧是复发的独立相关因素,HLA 等位基因的克隆性体细胞缺陷可导致逃逸 GvL 控制,I 类和 II 类 HLA 基因均受到体细胞突变影响。数据可用于白血病复发与 HLA 免疫遗传逃逸相关研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):移植物抗白血病(GvL)反应是异基因造血细胞移植作为髓系肿瘤治疗手段有效性的原因,供者 T 效应细胞借此识别白血病新抗原。然而,相当一部分患者因免疫反应未能控制白血病生长而复发。在此,我们通过一项广泛的免疫遗传学研究证明,人类白细胞抗原(HLA)异质性的种系与体细胞减少会提高白血病复发风险。我们表明,预先存在的种系编码的 II 类 HLA 基因型低进化分歧是与疾病复发相关的独立因素,并且 HLA 等位基因中克隆性体细胞缺陷的获得可能导致逃逸 GvL 控制。I 类和 II 类 HLA 基因均受到体细胞突变影响,作为克隆
【主题与分类】
主题标签:Raw sequence reads。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1094436
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1094436
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- OpenDataLab:
数据说明
移植物抗白血病(GvL)反应是异基因造血细胞移植作为髓系肿瘤治疗手段有效的关键机制,供者T效应细胞通过识别白血病新抗原发挥作用。然而,相当一部分患者因免疫应答未能控制白血病细胞生长而出现复发。本研究通过一项广泛的免疫遗传学研究证明,人类白细胞抗原(HLA)异质性的胚系和体细胞减少均会增加白血病复发风险。我们发现,预先存在的胚系编码II类HLA基因型低进化趋异性是与疾病复发相关的独立因素,而HLA等位基因克隆性体细胞缺陷的获得可能导致逃逸GvL控制。I类和II类HLA基因均可作为克隆选择因素被体细胞突变靶向,可能损害细胞免疫应答及对免疫调节策略的反应。
这些发现定义了移植后白血病逃逸的新分子模式,这些模式促进了疾病的复发。当前数据集提供了HLA外周血和骨髓样本,支持了本研究进行的基因分型研究。该样本集来源于接受异基因造血细胞移植后复发急性髓系白血病或骨髓增生异常综合征的患者。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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