急性髓系白血病间充质转录因子基因频繁去抑制(小鼠)
该数据集来自 EBI,为小鼠急性髓系白血病的转录组芯片研究,采用外显子阵列分析从患病小鼠分选获得的 CD117+Gr1+ 白血病细胞,比较 Hoxa9/对照、Hoxa9/Meis1 与 Hoxa9/FOXC1 三个队列,每队列 3 只小鼠、共 9 张芯片

基本信息
资源简介
急性髓系白血病间充质转录因子基因频繁去抑制(小鼠)
Frequent derepression of the mesenchymal transcription factor gene in acute myeloid leukemia (mouse)
该数据集来自 EBI,为小鼠急性髓系白血病的转录组芯片研究,采用外显子阵列分析从患病小鼠分选获得的 CD117+Gr1+ 白血病细胞,比较 Hoxa9/对照、Hoxa9/Meis1 与 Hoxa9/FOXC1 三个队列,每队列 3 只小鼠、共 9 张芯片。数据可用于研究 FOXC1 表达对小鼠 AML 转录组的影响,并支持白血病亚型相关的基因表达比较与分类分析(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):将表达 Hoxa9、Meis1、Foxc1 或对照空载体的逆转录病毒载体两两共转导至小鼠 CD45.1+ CD117+ 骨髓细胞。九十六小时后,将 10^6 个耐药细胞移植入 CD45.2+ 受照射的同源受体小鼠。为研究 FOXC1 表达对小鼠 AML 转录组的影响,我们对从患病小鼠回收的流式分选 CD117+Gr1+ 白血病细胞(Hoxa9/对照;Moxa9/Meis1;或 Hoxa9/FOXC1 白血病;每队列 3 只小鼠)进行了外显子阵列分析。共九张外显子阵列;每个队列(Hoxa9/对照;Moxa9/Meis1;或 Hoxa9/FOXC1)3 张阵列,每张来自一只独立小鼠。
【主题与分类】
主题标签:transcription profiling by array、Mus musculus。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-66253
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数据说明
E-GEOD-66253 急性髓系白血病中间充质转录因子基因频繁去抑制(小鼠)通过芯片进行转录谱分析 EFO EFO_0002768 小鼠 鼠CD45.1+ CD117+骨髓细胞通过表达Hoxa9、Meis1、Foxc1的逆转录病毒载体两两共转导
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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