RDI处理T-ALL细胞的表达数据
该数据集为RDI处理T-ALL细胞的表达数据，来源于ebi.ac.uk，属于肿瘤/白血病分类。数据基于转录组芯片，物种为Mus musculus
基本信息
资源简介
RDI处理T-ALL细胞的表达数据
Expression data from RDI treated T-ALL cells
该数据集为RDI处理T-ALL细胞的表达数据，来源于ebi.ac.uk，属于肿瘤/白血病分类。数据基于转录组芯片，物种为Mus musculus。源站描述显示，研究针对RUNX1与CBFB编码的核心结合因子亚基，利用78,000个类药化合物的计算筛选及优化获得Runt结构域抑制剂（RDIs），这些抑制剂直接结合RD并干扰Runx1:CBFβ相互作用。该数据可用于分析RDI处理对T-ALL细胞基因表达的影响，支持白血病靶向治疗相关研究（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：RUNX1和CBFB编码核心结合因子的亚基，是血液恶性肿瘤中染色体异常的常见靶点。我们此前确定，CBFβ（由CBFB编码）对于t(8;21)产生的嵌合蛋白AML1-ETO（RUNX1-RUNX1T1）的转化活性很重要，其他研究表明，正常的Runx1功能对于缺乏RUNX1或CBFB突变的一些白血病的生存和维持至关重要。因此，我们假设，通过用小分子抑制剂靶向Runx1:CBFβ相互作用，可以在多种白血病中实现治疗功效。利用Runx1的DNA结合Runt结构域（RD）及其与CBFβ的界面结构，我们对78,000个类药化合物库进行了计算筛选，并进一步优化了我们的初始命中物。Runt结构域抑制剂（RDIs）直接结合RD并干扰
【主题与分类】
主题标签：transcription profiling by array、Mus musculus。本站分类：肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-70495
下载信息
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
携带t(8;21)的小鼠和人类白血病细胞，而非正常骨髓细胞。RDIs对未携带t(8;21)的小鼠和人类T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）细胞系具有相似效应。一株小鼠T-ALL细胞系720，源自表达Tal1的Tcf12+/-小鼠。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
