小鼠APL肿瘤外显子阵列数据
该数据集为小鼠急性早幼粒细胞白血病（APL）肿瘤的外显子阵列转录组数据，来源于ebi.ac.uk，分类为肿瘤/白血病。源站描述显示，研究围绕PML-RARA融合基因驱动的APL小鼠模型，通过全基因组测序发现Jak1 V657F等体细胞突变及Kdm6a/Utx缺失，并涉及与人类APL、ALL及AML样
基本信息
资源简介
小鼠APL肿瘤外显子阵列数据
Exon array data from mouse APL tumors
该数据集为小鼠急性早幼粒细胞白血病（APL）肿瘤的外显子阵列转录组数据，来源于ebi.ac.uk，分类为肿瘤/白血病。源站描述显示，研究围绕PML-RARA融合基因驱动的APL小鼠模型，通过全基因组测序发现Jak1 V657F等体细胞突变及Kdm6a/Utx缺失，并涉及与人类APL、ALL及AML样本的比对。数据可用于白血病相关基因表达分析及突变协同机制研究（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：急性早幼粒细胞白血病（APL）以t(15;17)(q22;q11.2)易位为特征，该易位产生PML-RARA融合基因，可在小鼠中引发APL。为发现该模型中的协同突变，我们将一个小鼠APL基因组测序至15.6倍单倍体覆盖度，并发现了三个体细胞非同义突变，其中一个（Jak1 V657F）为复发性突变。该突变与先前在人类APL和ALL样本中发现的JAK1 V658F突变相同。JAK1 V658F在体内与PML-RARA协同作用，导致快速致命的白血病。我们还在小鼠APL基因组中发现了一个涉及Kdm6a/Utx基因的150kb体细胞缺失；另外14个小鼠APL样本中有3个具有类似的涉及Kdm6a/Utx的缺失。Kdm6A/Utx是一种组蛋白H3K27去甲基化酶，在测试的150个人类AML样本中也有1个被缺失。小鼠癌症基因组的全基因组测序为发现……提供了一种无偏倚的方法
【主题与分类】
主题标签：transcription profiling by array、Mus musculus。本站分类：肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-26128
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
E-GEOD-26128 小鼠APL肿瘤外显子阵列数据，通过阵列进行转录谱分析 EFO EFO_0002768 小家鼠 急性早幼粒细胞白血病（APL）的特征是t(15;17)(q22;q11.2)易位，该易位产生PML-RARA融合基因，能够在小鼠中引发APL。为了发现协同
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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