AICAr处理的原代急性髓系白血病细胞转录组

该数据集来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验,物种为 Homo sapiens,内容为经 AICAr 处理的原代急性髓系白血病(AML)细胞的转录组

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基因组预测Differential
E-MTAB-9209: Transcriptome of primary acute myeloid leukemia (AML) cells treated with AICAr

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

AICAr处理的原代急性髓系白血病细胞转录组

E-MTAB-9209 是一项收录于 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集,英文全称为 Transcriptome of primary acute myeloid leukemia (AML) cells treated with AICAr。该数据集以 Homo sapiens 为研究物种,聚焦于原代急性髓系白血病(AML)细胞在 AICAr 处理条件下的转录组变化,属于肿瘤/白血病分类下的表达谱研究资源。其核心价值在于通过差异表达分析,呈现 AICAr 干预前后原代 AML 细胞转录组的对比信息,为关注白血病细胞转录响应、药物干预机制及表达调控的研究者提供可检索、可复用的公共数据入口。数据集的主题标签为 Differential,表明其设计围绕组间差异比较展开,而非单纯的基线表达谱描述。

【数据集背景】

急性髓系白血病是起源于髓系造血干/祖细胞的恶性血液肿瘤,原代患者来源的 AML 细胞相较细胞系更能反映临床样本的生物学特征。AICAr(5-氨基咪唑-4-甲酰胺核糖核苷酸)是一种在代谢与核苷酸相关研究中被使用的化合物。该数据集正是在这一背景下,对经 AICAr 处理的原代 AML 细胞进行转录组层面的差异表达刻画,属于 EBI Expression Atlas 中 Differential 类实验的组成部分,服务于基因表达变化的研究需求。

【数据内容】

数据集的内容为原代急性髓系白血病(AML)细胞经 AICAr 处理后的转录组表达数据,实验类型为差异表达实验。其主题标签为 Differential,说明数据组织方式以处理组与对照(或不同条件)之间的表达差异为核心。物种信息明确为 Homo sapiens。关于具体样本数量、测序平台、基因数量、差异基因列表及统计阈值等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,收录于 EBI Expression Atlas,实验编号为 E-MTAB-9209。源站将其描述为 Expression Atlas experiment (Differential),物种为 Homo sapiens,内容为经 AICAr 处理的原代 AML 细胞转录组。除上述来源与归属信息外,样本采集地点、患者临床信息、处理浓度与时长、建库与测序细节等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于白血病转录组差异表达相关的研究场景,例如考察 AICAr 处理对原代 AML 细胞基因表达谱的影响、筛选候选差异表达基因、与其他 AML 表达数据开展比较分析,以及作为公共表达资源用于方法学验证或假设生成。由于主题标签为 Differential,其典型用途集中在组间表达对比而非单纯表达量查询。具体可支持的深入分析类型受限于源站所提供的信息范围。

【使用方法】

使用者可通过 EBI Expression Atlas 平台访问该实验(编号 E-MTAB-9209),依据平台提供的差异表达结果进行基因层面的检索与浏览。关于数据下载格式、分析流程参数、归一化方法及可视化选项等操作细节,源站未提供,需以平台实际页面说明为准。

【质量与限制】

该数据集为公共数据库收录的差异表达实验,其物种与实验主题信息明确。但样本规模、测序深度、统计显著性阈值、批次效应处理及生物学重复情况等质量相关参数,源站未提供,使用时应结合平台原始记录自行评估。此外,原代 AML 细胞的特异性与处理条件差异可能影响结果的外推,具体限制信息源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 EBI Expression Atlas,实验编号为 E-MTAB-9209。关于引用方式、原始文献出处及许可条款,源站未提供,使用与再分发前应查阅平台相应说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-9209

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Transcriptome of primary acute myeloid leukemia (AML) cells treated with AICAr

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