E-MTAB-1776:研究慢性淋巴细胞白血病突变的人B细胞RNA测序

内容是对人 B 细胞进行 RNA 测序,用于研究在造血多能祖细胞组分中观察到的慢性淋巴细胞白血病突变。数据覆盖肿瘤/白血病方向,主题标签为 Differential

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基因组分类Differential
E-MTAB-1776: RNA-sequencing of human B cells to investigate chronic lymphocytic leukemia mutations observed in hematopoietic multipotent progenitor fractions

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

E-MTAB-1776:研究慢性淋巴细胞白血病突变的人B细胞RNA测序

E-MTAB-1776 是一项以人 B 细胞为研究对象的 RNA 测序实验,全称为“RNA-sequencing of human B cells to investigate chronic lymphocytic leukemia mutations observed in hematopoietic multipotent progenitor fractions”。该数据集聚焦于慢性淋巴细胞白血病相关突变的研究,这些突变在造血多能祖细胞组分中被观察到。从分类上看,它归属于肿瘤 / 白血病方向,主题标签为 Differential,表明该实验属于差异表达分析类研究。数据来源于 ebi.ac.uk,是 Expression Atlas 中的一项差异表达实验,物种为 Homo sapiens。整体而言,该数据集通过转录组层面的测序手段,为理解慢性淋巴细胞白血病在造血多能祖细胞阶段的突变特征提供了 RNA 测序数据基础。

【数据集背景】

慢性淋巴细胞白血病是一种涉及 B 细胞异常的血液系统恶性肿瘤。该数据集的核心研究目标,是探究在造血多能祖细胞组分中观察到的慢性淋巴细胞白血病突变。通过对人 B 细胞进行 RNA 测序,研究者试图从转录组层面捕捉与这些突变相关的表达变化。该实验被收录于 Expression Atlas,属于差异表达实验类型,说明其设计目的在于比较不同条件或分组之间的基因表达差异,而非仅提供静态的表达谱。数据集的分类为肿瘤 / 白血病,主题标签为 Differential,进一步明确了其在肿瘤转录组差异分析中的定位。

【数据内容】

该数据集的内容是对人 B 细胞进行 RNA 测序。实验围绕慢性淋巴细胞白血病突变展开,这些突变在造血多能祖细胞组分中被观察到。作为一项差异表达实验,其数据应包含用于比较的表达信息,但关于具体样本数量、测序深度、基因数量、差异表达基因列表等细节,源站未提供。数据主题标签为 Differential,表明其核心内容与差异表达分析相关。物种信息明确为 Homo sapiens,研究对象为人 B 细胞。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk,具体收录于 Expression Atlas,实验编号为 E-MTAB-1776。源站描述指出,这是一项 Differential 类型的 Expression Atlas 实验,物种为 Homo sapiens,内容为 RNA-sequencing of human B cells to investigate chronic lymphocytic leukemia mutations observed in hematopoietic multipotent progenitor fractions。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息、测序平台型号、建库方法等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤 / 白血病方向的研究,尤其是与慢性淋巴细胞白血病相关的转录组分析。由于主题标签为 Differential,它可用于差异表达分析相关的场景,例如比较不同条件下人 B 细胞的基因表达变化,或探索与在造血多能祖细胞组分中观察到的慢性淋巴细胞白血病突变相关的表达特征。其 RNA 测序数据也可用于转录组层面的探索性分析。但具体适用的分析类型、可支持的统计方法等,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 获取,具体位于 Expression Atlas 中,实验编号为 E-MTAB-1776。作为一项差异表达实验,使用者可依据 Expression Atlas 的常规访问方式获取数据。关于数据下载格式、是否需要特定工具、是否有配套分析流程、如何引用等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas,属于 Differential 实验。关于数据质量指标、测序质量、重复数、批次效应、样本量、统计功效等,源站未提供。其研究范围限定于人 B 细胞的 RNA 测序,并聚焦于在造血多能祖细胞组分中观察到的慢性淋巴细胞白血病突变,因此结论的适用范围可能受此限制。其他潜在限制,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、是否允许再分发等,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-1776

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. RNA-sequencing of human B cells to investigate chronic lymphocytic leukemia mutations observed in hematopoietic multipotent progenitor fractions

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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