Duplex sequencing揭示KMT2A重排婴儿急性白血病复发性低频癌症相关突变

该数据集包含20名婴儿和7名儿童急性淋巴细胞白血病患者的Duplex sequencing与靶向下一代测序(NGS)数据,所有患者均携带KMT2A基因重排

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2025-01-15 更新
浏览 3
基因组分类leukemiaduplex sequencing method
Duplex sequencing uncovers recurrent low-frequency cancer-associated mutations in KMT2A-rearranged infant acute leukemia

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
许可
Restricted Access
创建/更新时间
2025-01-15
版本
v1

资源简介

Duplex sequencing揭示KMT2A重排婴儿急性白血病复发性低频癌症相关突变

Duplex sequencing uncovers recurrent low-frequency cancer-associated mutations in KMT2A-rearranged infant acute leukemia

该数据集包含20名婴儿和7名儿童急性淋巴细胞白血病患者的Duplex sequencing与靶向下一代测序(NGS)数据,所有患者均携带KMT2A基因重排。诊断样本来自外周血或骨髓,部分变异经靶向多重PCR和NGS验证,6例有复发样本的患者还进行了诊断变异筛查。数据可用于研究KMT2A重排婴儿白血病中的低频癌症相关突变及复发相关变异(来源 figshare,Restricted Access 许可)。

【数据集背景】

项目资助方:PR2018-0027。源站首次发布:2022-04-19。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包括20名婴儿和7名儿童急性淋巴细胞白血病患者的Duplex sequencing和靶向下一代测序(NGS)。所有患者均存在KMT2A基因重排,分别为KMT2A::MLLT3(n=5)、KMT2A::AFF1(n=12)、KMT2A::MLLT1(n=8)或KMT2A::MLLT10(n=2)。队列中位年龄为7个月。来自外周血(n=11)或骨髓(n=16)的诊断样本按照 sequencing文库制备,并在NextSeq 500(Illumina,San Diego,CA,USA)上测序。一部分变异通过靶向多重PCR后接NGS进行验证。在六名有可用复发样本的患者中,通过多重PCR和NGS对诊断变异进行了筛查。所有靶向测序文库均使用Nextera XT DNA Sample Preparation Kit(Illumina)制备并测序

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.17044/scilifelab.19380116.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Sequence analysis。主题标签:leukemia、duplex sequencing method。本站分类:肿瘤/白血病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Sequence analysis。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.scilifelab.se/articles/dataset/Duplex_sequencing_uncovers_recurrent_low-frequency_cancer-associated_mutations_in_KMT2A-rearranged_infant_acute_leukemia/19380116

使用许可:Restricted Access(https://www.scilifelab.se/data/restricted-access/)。

规范引用:Pilheden, Mattias; Hagström Andersson, Anna (2022). Duplex sequencing uncovers recurrent low-frequency cancer-associated mutations in KMT2A-rearranged infant acute leukemia. Lund University. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2025-01-15,引用时请注意版本时效。

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源站:https://figshare.scilifelab.se/articles/dataset/Duplex_sequencing_uncovers_recurrent_low-frequency_cancer-associated_mutations_in_KMT2A-rearranged_infant_acute_leukemia/19380116

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Mattias Pilheden; Anna Hagström Andersson (2025). Duplex sequencing uncovers recurrent low-frequency cancer-associated mutations in KMT2A-rearranged infant acute leukemia [Dataset]. http://doi.org/10.17044/scilifelab.19380116.v1

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