9种不同癌症组织来源（乳腺、中枢神经系统、结肠、白血病、黑色素瘤、非小细胞肺癌、卵巢、前列腺、肾）的NCI-60细胞系比较基因组杂交数据集

资源简介

9种不同癌症组织来源（乳腺、中枢神经系统、结肠、白血病、黑色素瘤、非小细胞肺癌、卵巢、前列腺、肾）的NCI-60细胞系比较基因组杂交数据集

该数据集为比较基因组杂交（Comparative Genomic Hybridization, CGH）数据，来源于NCI-60细胞系面板，覆盖9种不同癌症组织来源类型，包括乳腺癌、中枢神经系统肿瘤、结肠癌、白血病、黑色素瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、前列腺癌和肾癌。数据集由Joe Gray、John Weinstein、Kimberly Bussey和Koei Chin于2005年发布，收录于EBI ArrayExpress平台，编号为E-TABM-65。该数据集属于肿瘤领域，本站分类为肿瘤/白血病，主题标签涵盖肿瘤、白血病、比较基因组杂交、NCI-60 panel、细胞系及癌症组织来源，可用于探索不同组织来源癌细胞系的基因组变异特征。

【数据集背景】

NCI-60 panel是美国国家癌症研究所建立的一套广泛使用的癌细胞系集合，涵盖多种组织来源的肿瘤模型。比较基因组杂交是一种用于检测基因组拷贝数变化的技术，能够揭示肿瘤细胞中染色体水平的增益和缺失。该数据集基于NCI-60 panel中的细胞系，针对9种不同癌症组织来源类型开展CGH实验，旨在提供这些细胞系在基因组层面的比较数据。该数据集由Joe Gray、John Weinstein、Kimberly Bussey和Koei Chin于2005年发布，来源站为ebi.ac.uk，属于肿瘤领域公开数据集。

【数据内容】

该数据集包含来自9种不同癌症组织来源类型的细胞系的比较基因组杂交数据。这9种组织来源类型分别为：乳腺癌、中枢神经系统肿瘤、结肠癌、白血病、黑色素瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、前列腺癌和肾癌。数据集主题标签包括肿瘤、白血病、比较基因组杂交、NCI-60 panel、细胞系、癌症组织来源。本站分类为肿瘤/白血病。关于具体样本数量、基因位点数目、数据文件格式或数据量大小等信息，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为ebi.ac.uk，具体收录于EBI ArrayExpress平台，研究编号为E-TABM-65。数据由Joe Gray、John Weinstein、Kimberly Bussey和Koei Chin于2005年发布。源站描述中标注了该数据集为比较基因组杂交数据，涉及NCI-60 panel中9种不同癌症组织来源类型的细胞系。关于具体的实验操作流程、样本制备方法、杂交条件或扫描参数等细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤基因组学相关研究，尤其是针对不同组织来源癌症细胞系的基因组拷贝数变异分析。由于涵盖NCI-60 panel中的多种癌症类型，可用于比较不同组织来源肿瘤细胞系之间的基因组差异，也可用于白血病相关研究。此外，该数据集可支持比较基因组杂交技术的应用研究，以及癌症细胞系模型的基因组特征探索。关于具体的分析工具或下游应用案例，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过来源站ebi.ac.uk获取，具体位于EBI ArrayExpress平台的E-TABM-65研究条目下。用户可根据源站提供的访问方式下载或查询数据。关于数据的具体使用步骤、预处理方法、标准化流程或分析软件推荐，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于EBI ArrayExpress平台，由Joe Gray、John Weinstein、Kimberly Bussey和Koei Chin于2005年发布。关于数据的具体质量评估指标、缺失值情况、批次效应、技术重复或验证实验等信息，源站未提供。此外，关于该数据集在样本量、覆盖范围或技术分辨率方面的限制，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用信息为：Joe Gray; John Weinstein; Kimberly Bussey; Koei Chin (2005). Comparative genomic hybridization of cell lines from 9 different cancer tissue of origin types (Breast, Central Nervous System, Colon, Leukemia, Melanoma, Non-Small Cell Lung, Ovarian, Prostate, Renal) from NCI-60 panel [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-TABM-65。关于该数据集的许可条款或使用限制，源站未提供。