ccRCC中ECHDC1过表达RNA-seq数据集

数据可用于分析ECHDC1在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的表达变化及其下游转录影响,支持差异表达、通路富集等RNA-seq下游分析,为研究ECHDC1在ccRCC中的功能提供转录组层面的数据基础(来源 DOI 解析,restricted access 许可)

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基因组分类BiologyRNA-seqECHDC1ccRCC
RNA-seq of ECHDC1 overexperssion in ccRCC

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
许可
restricted access
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

ccRCC中ECHDC1过表达RNA-seq数据集

该数据集英文名为 RNA-seq of ECHDC1 overexperssion in ccRCC,聚焦于透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中 ECHDC1 过表达后的转录组变化。数据来源于 doi.org,源站将其描述为 ECHDC1 过表达的 CAKI-1 细胞的 mRNA 序列。数据集由 Zhao Chuanyi 提交,机构为 Science Data Bank,发布时间为 2026 年,采用 restricted access 许可。主题标签涵盖 Biology、RNA-seq、ECHDC1 与 ccRCC,本站分类归入肿瘤 / 肾癌。整体而言,该数据为在转录组层面考察 ECHDC1 在 ccRCC 中的表达变化及其下游转录影响提供了原始测序资料,可用于差异表达分析、通路富集等 RNA-seq 下游研究,从而支撑对 ECHDC1 在 ccRCC 中功能的探索。

【数据集背景】

透明细胞肾细胞癌(ccRCC)是肾癌中的常见亚型,围绕其分子机制的研究常借助转录组测序来观察基因表达改变及由此引发的下游转录响应。ECHDC1 是该数据集关注的目标基因,数据集以 ECHDC1 过表达为切入点,构建相应的细胞模型并开展 RNA-seq,以获取过表达条件下的 mRNA 序列信息。该数据集的主题标签明确指向 Biology、RNA-seq、ECHDC1 与 ccRCC,本站分类为肿瘤 / 肾癌,说明其面向肾癌分子机制研究场景。数据集英文名中的 “overexperssion” 为原始命名中的拼写形式,指向 ECHDC1 过表达这一实验条件。发布时间标注为 2026 年,机构为 Science Data Bank,作者为 Zhao Chuanyi。

【数据内容】

依据源站描述,该数据集的内容为 ECHDC1 过表达的 CAKI-1 细胞的 mRNA 序列。也就是说,数据主体是来自 ECHDC1 过表达细胞模型的 RNA-seq 测序结果,反映的是转录本层面的序列信息。主题标签中的 RNA-seq 与 ECHDC1、ccRCC 共同界定了数据的内容范围:以 RNA 测序手段获取 ECHDC1 过表达背景下的转录组数据,服务于 ccRCC 相关研究。关于样本数量、测序平台、读长、重复设置、数据文件格式与具体文件数量等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 doi.org,源站对其的描述为 ECHDC1 过表达的 CAKI-1 细胞的 mRNA 序列。数据由 Zhao Chuanyi 提交,所属机构为 Science Data Bank,发布时间为 2026 年。数据主题标签包括 Biology、RNA-seq、ECHDC1、ccRCC,本站将其归类为肿瘤 / 肾癌。关于具体的细胞培养条件、过表达构建方式、测序建库流程、测序仪器型号及测序深度等实验与测序细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据可用于分析 ECHDC1 在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的表达变化及其下游转录影响,支持差异表达、通路富集等 RNA-seq 下游分析,为研究 ECHDC1 在 ccRCC 中的功能提供转录组层面的数据基础。具体而言,研究者可围绕 ECHDC1 过表达条件下 CAKI-1 细胞的 mRNA 序列,开展转录组层面的比较与功能注释类分析。关于该数据在其他研究场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

该数据集采用 restricted access 许可,使用前需按相应访问限制获取数据。获得数据后,可依据 RNA-seq 的一般分析流程开展下游分析,例如差异表达分析与通路富集分析,以考察 ECHDC1 过表达引起的转录变化。关于具体的分析参数、参考基因组版本、标准化方法及推荐软件流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 restricted access 许可,访问受到限制。源站描述仅说明其为 ECHDC1 过表达的 CAKI-1 细胞的 mRNA 序列,关于数据质量评估指标、测序深度、重复数、批次信息及质控结果等,源站未提供。数据仅涉及 ECHDC1 过表达的 CAKI-1 细胞模型,关于其他细胞系或样本类型的信息,源站未提供。使用时需注意许可限制对数据获取与再分发的影响。

【引用与许可】

该数据集作者为 Zhao Chuanyi,机构为 Science Data Bank,发布时间为 2026 年,来源站为 doi.org,许可为 restricted access。引用时应遵循源站提供的引用规范;关于具体引用格式与许可条款细节,源站未提供。

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源站:https://doi.org/10.57760/sciencedb.015cb

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

The mRNA sequence of ECHDC1-overexperssed CAKI-1 cells

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