AQP1基因过表达在RENCA细胞系中作用的转录组数据
该数据集来自NCBI,属于肿瘤/肾癌分类,主题标签为Raw sequence reads。研究通过慢病毒转导构建稳定过表达AQP1的RENCA小鼠肾细胞癌细胞系及阴性对照,转导两周后每组取三个生物学重复提取总RNA,进行双端高通量RNA测序

基本信息
资源简介
AQP1基因过表达在RENCA细胞系中作用的转录组数据
该数据集来自NCBI,属于肿瘤/肾癌分类,主题标签为Raw sequence reads。研究通过慢病毒转导构建稳定过表达AQP1的RENCA小鼠肾细胞癌细胞系及阴性对照,转导两周后每组取三个生物学重复提取总RNA,进行双端高通量RNA测序。数据提供过表达AQP1的RENCA细胞与阴性对照细胞的转录组图谱,可用于鉴定差异表达基因、通路以及AQP1影响肾癌生物学的潜在机制(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):水通道蛋白-1(AQP1)已被认为与多种癌症的肿瘤进展有关,包括细胞迁移、侵袭和血管生成,但其在肾透明细胞癌中的具体作用仍不完全清楚。为了研究肾癌中与AQP1过表达相关的转录组变化,我们使用慢病毒转导生成了稳定过表达AQP1的RENCA细胞(一种小鼠肾细胞癌细胞系)及相应的阴性对照细胞。转导后两周,从每组三个生物学重复中提取总RNA,并进行双端高通量RNA测序(RNA-seq)。该数据集提供了比较过表达AQP1的RENCA细胞与阴性对照细胞的转录组图谱,旨在鉴定差异表达基因、通路以及AQP1影响肾癌生物学的潜在机制。该数据
【主题与分类】
主题标签:Raw sequence reads。本站分类:肿瘤/肾癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1399096
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1399096
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
水通道蛋白-1(AQP1)已被认为与多种癌症的肿瘤进展相关,包括细胞迁移、侵袭和血管生成,但其在肾透明细胞癌中的具体作用仍不完全清楚。为了研究与肾癌中AQP1过表达相关的转录组变化,我们利用慢病毒转导生成了稳定过表达AQP1的RENCA细胞(一种小鼠肾细胞癌细胞系)及相应的阴性对照细胞。转导后两周,从每组三个生物学重复中提取总RNA,并进行配对末端高通量RNA测序(RNA-seq)。该数据集提供了比较AQP1过表达RENCA细胞与阴性对照细胞的转录组图谱,旨在识别差异表达基因、通路以及AQP1影响肾癌生物学的潜在机制。这些数据可能有助于进一步研究AQP1作为肾透明细胞癌治疗靶点或生物标志物的潜力。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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