线粒体电子传递链对糖酵解的氧依赖性约束数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.21950/CMDHRD

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

缺氧诱导因子（HIFs）在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞中呈组成性激活状态。在此，我们探究这些细胞是否仍能独立于经典HIF激活途径对缺氧作出响应。我们发现，当细胞外丙酮酸供应受限时，缺氧会引发NADH还原应激，从而减弱乳酸释放，而通过异位表达胞质和线粒体靶向的NADH氧化酶（LbNOX）可恢复这一反应。仅抑制线粒体电子传递链（mtETC）就足以在细胞外丙酮酸有限时减弱糖酵解通量，这一情况与人类ccRCC的代谢组学数据一致。此外，通过药理学或遗传学手段抑制线粒体复合物IV活性可模拟这一反应，而线粒体靶向的替代氧化酶（AOX）则可恢复该反应。因此，我们的数据表明，当丙酮酸可用性受损时，细胞可通过线粒体依赖性的NADH/NAD+升高来响应低氧张力，从而导致糖酵解受到抑制。

该数据集分为三个文件夹：第一个文件夹名为代谢与RNA蛋白质数据。第二个文件夹名为显微镜数据。该文件夹内包含两个额外的子文件夹，分别命名为“图S2A”和“图S2D”，以及一个Excel文件，其中包含了关于图S2A和图S2D数据集的信息。第三个文件夹名为Western印迹数据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。