液体生物标志物与肾癌中TGF-β I型受体及缺氧的关联
该数据集包含透明细胞肾细胞癌患者与健康对照者的血液蛋白质组学数据(通过邻近延伸分析法测量92种肿瘤相关蛋白)以及部分患者的实体肿瘤蛋白质表达数据,主要模态为蛋白质生物标志物和临床关联信息,用于识别与肾癌诊断、预后相关的关键液体生物标志物,并研究这些标志物与TGF-β和缺氧信号通路的分子关联,以支持精准医疗和疾病机制探索。

基本信息
资源简介
液体生物标志物与肾癌中TGF-β I型受体及缺氧的关联
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Liquid biomarkers associate with TGF-beta Type I receptor and hypoxia in kidney cancer》。配套论文《Liquid biomarkers associate with TGF-β Type I receptor and hypoxia in kidney cancer》发表于 Signal Transduction and Targeted Therapy(2025),DOI:10.1038/s41392-025-02404-7。源站首次发布:2025-08-18。
【数据内容】
源站原始描述:Clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) is an aggressive kidney cancer subtype frequently associated with poor prognosis. Most ccRCC cases are asymptomatic in early stages and symptomatic mostly in advanced stages. Furthermore, the heterogeneity of ccRCC presents a challenge to design new treatments. In this study, using proximity extension assay (PEA), we analyzed blood samples from 134 patients with ccRCC and from 111 age- and gender-matched healthy donors. We identified a panel of seven prote…
主表 Supplementary_Data_S1.csv 含 107 列、样本前 246 行结构完整。
主表 Supplementary_Data_S2.csv 含 106 列、样本前 246 行结构完整。
主表 Supplementary_Data_S3.csv 含 6 列、样本前 92 行结构完整。
【数据结构与技术规格】
文件数 21 个,合计 3.26 MB。Supplementary_Data_S1.csv:text/csv,195.54 KB。Supplementary_Data_S2.csv:text/csv,205.36 KB。Supplementary_Data_S3.csv:text/csv,4.92 KB。数据集 DOI:10.17044/scilifelab.28711088.v1。
【主题与分类】
源站学科分类:Proteomics and intermolecular interactions (excl. medical proteomics)、Systems biology、Signal transduction、Proteomics and metabolomics、Translational and applied bioinformatics、Liquid biopsies。主题标签:Olink、Liquid biomarker、clear cell renal cell cancer (ccRCC)、TGF-ß signaling。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。源站学科分类标注为 Proteomics and intermolecular interactions (excl. medical proteomics)、Systems biology、Signal transduction、Proteomics and metabolomics、Translational and applied bioinformatics、Liquid biopsies。
【获取与许可】
源站页面:https://figshare.scilifelab.se/articles/dataset/Liquid_biomarkers_associate_with_TGF-beta_Type_I_receptor_and_hypoxia_in_kidney_cancer/28711088
使用许可:CC BY-NC-SA 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/)。
规范引用:Erdem, Cemal; Mallikarjuna, Pramod; Beorlegui, Ruben; Larsson, Anders; Ljungberg, Börje; Kamali-Moghaddam, Masood; et al. (2025). Liquid biomarkers associate with TGF-beta Type I receptor and hypoxia in kidney cancer. Umeå University. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-09-29,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集专注于透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的液体生物标志物研究。通过使用邻近延伸分析法(PEA),分析了134名ccRCC患者和111名年龄、性别匹配的健康对照者的血液样本,测量了92种肿瘤相关蛋白水平。研究鉴定出与临床病理参数和患者生存相关的7种关键蛋白(ANXA1、ESM1、FGFBP1、MDK、METAP2、SDC1和TFPI2),这些生物标志物能以高灵敏度和特异性区分患者与健康个体。同时,通过分析同一患者队列的实体肿瘤样本,揭示了这些生物标志物与TGF-β和VHL-HIF信号通路蛋白(如TGFBR1、HIF-1α、HIF-2α、pVHL)的关联。该数据集主要用于探索ccRCC的诊断、预后生物标志物,以及其与关键信号通路的分子机制联系,为个性化医疗提供潜在资源。
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