通过整合基因组和转录组分析识别肾髓样癌新治疗靶点数据集
该数据集包含15例肾髓样癌（RMC）样本的全外显子组测序和批量RNA测序数据，涵盖基因组和转录组两种模态，通过分析肿瘤微环境组成和基因表达谱，识别出TROP2、EPCAM、CLDN6和CDH6等细胞表面标志物作为潜在治疗靶点，并提供了初步的靶向治疗临床观察结果，主要用于肾癌靶点发现、精准肿瘤治疗策略开发和肿瘤微环境研究。
基本信息
资源简介
通过整合基因组和转录组分析识别肾髓样癌新治疗靶点数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Identification of New Therapeutic Targets for Renal Medullary Carcinoma via Integrated Genomic and Transcriptomic Profiling》。源站首次发布：2025-06-20。
【数据内容】
源站原始描述：Purpose: Renal medullary carcinoma (RMC) is a rare, aggressive kidney cancer associated with sickle cell trait, characterized by SMARCB1 loss and resistance to conventional therapies used for other renal cell carcinomas (RCC). This study aimed to perform comprehensive histopathologic, genomic, and transcriptomic profiling of RMC tissues to identify novel therapeutic targets. Experimental Design: We conducted whole exome sequencing (WES) and bulk RNA-sequencing (RNA-seq) on 15 RMC samples, using…
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI：10.5281/zenodo.15345886。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/15345886
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-05-20，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.15345886
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数据说明
该数据集旨在通过整合基因组和转录组分析，识别肾髓样癌（RMC）的新治疗靶点。RMC是一种罕见且侵袭性的肾癌，与镰状细胞性状相关，以SMARCB1缺失和常规肾细胞癌疗法耐药为特征。数据集包含15个RMC样本的全外显子组测序（WES）和批量RNA测序（RNA-seq）数据，通过细胞反卷积分析肿瘤微环境（TME）组成，并与其它肾细胞癌、实体瘤、神经内分泌肿瘤及癌症基因组图谱数据进行比较。研究还通过免疫组化（IHC）验证了TROP2等靶点表达，并报告了4例高TROP2表达患者接受sacituzumab govitecan治疗的初步临床结果。该数据集为RMC的分子特征提供了迄今最全面的分析，突出了TROP2、EPCAM、CLDN6和CDH6等细胞表面标志物作为潜在治疗靶点，主要应用于精准肿瘤治疗、肾癌靶点发现和肿瘤微环境研究。
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