通过整合基因组和转录组分析识别肾髓样癌新治疗靶点数据集

该数据集包含15例肾髓样癌(RMC)样本的全外显子组测序和批量RNA测序数据,涵盖基因组和转录组两种模态,通过分析肿瘤微环境组成和基因表达谱,识别出TROP2、EPCAM、CLDN6和CDH6等细胞表面标志物作为潜在治疗靶点,并提供了初步的靶向治疗临床观察结果,主要用于肾癌靶点发现、精准肿瘤治疗策略开发和肿瘤微环境研究。

Zenodo
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2025-05-29 更新
肾癌靶点发现精准肿瘤治疗
创建时间2025-05-20
更新时间2025-05-29
原始链接

https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.15345886

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资源简介

该数据集旨在通过整合基因组和转录组分析,识别肾髓样癌(RMC)的新治疗靶点。RMC是一种罕见且侵袭性的肾癌,与镰状细胞性状相关,以SMARCB1缺失和常规肾细胞癌疗法耐药为特征。数据集包含15个RMC样本的全外显子组测序(WES)和批量RNA测序(RNA-seq)数据,通过细胞反卷积分析肿瘤微环境(TME)组成,并与其它肾细胞癌、实体瘤、神经内分泌肿瘤及癌症基因组图谱数据进行比较。研究还通过免疫组化(IHC)验证了TROP2等靶点表达,并报告了4例高TROP2表达患者接受sacituzumab govitecan治疗的初步临床结果。该数据集为RMC的分子特征提供了迄今最全面的分析,突出了TROP2、EPCAM、CLDN6和CDH6等细胞表面标志物作为潜在治疗靶点,主要应用于精准肿瘤治疗、肾癌靶点发现和肿瘤微环境研究。

提供机构:Zenodo

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