IDC TCGA-KICH 肾嫌色细胞癌影像数据集

IDC TCGA-KICH 是来自影像数据共享平台 IDC 的 TCGA 肾嫌色细胞癌(Kidney Chromophobe)影像数据集合,属于肿瘤/肾癌方向,共纳入 113 例受试者,肿瘤部位为肾脏

idc
浏览 32
医学影像分类Kidney ChromophobeKidney
IDC TCGA-KICH

基本信息

模态
医学影像
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

IDC TCGA-KICH 肾嫌色细胞癌影像数据集

IDC TCGA-KICH 是影像数据共享平台 IDC(Imaging Data Commons)收录的一个影像数据集合,主题为肾嫌色细胞癌(Kidney Chromophobe),在分类上属于肿瘤 / 肾癌方向。该集合来源于 portal.imaging.datacommons.cancer.gov,共纳入 113 例受试者,肿瘤部位为肾脏。作为 TCGA 相关影像资源的一部分,它面向肾嫌色细胞癌这一特定癌种,汇集了经过整理的放射学影像资料,可供影像与肿瘤相关研究使用。该集合的主题标签包括 Kidney Chromophobe 与 Kidney,便于在数据平台中按癌种和器官部位进行检索与定位。

【数据集背景】

该数据集合是 TCGA(The Cancer Genome Atlas,癌症基因组图谱)整体工作的一部分,其目标是在已有的 TCGA 数据集基础上补充经过特征化处理的放射学影像。TCGA 本身是一个大型的癌症基因组研究项目,而 TCGA-KICH 对应的是其中的肾嫌色细胞癌病例。癌症影像计划(Cancer Imaging Program,CIP)与多家为 TCGA 提供组织的机构合作,对已经完成基因分析的 KICH 病例的放射学影像进行了归档,从而形成了这一影像集合。因此,该集合在定位上属于对 TCGA 分子与临床数据的影像学补充,而非独立的临床或基因组数据集。

【数据内容】

该集合对应的癌种为肾嫌色细胞癌(Kidney Chromophobe),肿瘤部位为肾脏,受试者数量为 113 例。集合的主题标签为 Kidney Chromophobe 和 Kidney。除上述信息外,关于影像的具体模态构成、序列数量、图像数量、文件格式分布等细节,源站未提供。集合还涉及 DICOM 转换的 Slide Microscopy 图像,相关说明指向专门的页面,但该页面所包含的具体内容在此未予展开。

【采集与来源】

该集合的来源站为 portal.imaging.datacommons.cancer.gov。其影像来自 TCGA 组织贡献机构所提供病例的放射学影像,由癌症影像计划(CIP)与这些机构合作完成归档。集合的源站描述中提供了指向 TCGA-KICH 专门页面的链接,用于了解放射学影像的更多信息并获取该集合的支持性元数据;同时提供了指向 DICOM 转换的 Slide Microscopy 图像页面的链接,用于了解组织病理相关影像的更多信息。关于采集设备、扫描参数、采集时间跨度、机构分布等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其癌种与部位属性,该集合可用于肾嫌色细胞癌相关的影像研究,例如与 TCGA 已有的基因组、临床数据进行关联分析,或用于放射学影像的特征描述与影像组学研究。它也可作为 TCGA 影像资源的一部分,支持跨癌种的比较研究或数据整合工作。由于集合同时涉及放射学影像与 DICOM 转换的 Slide Microscopy 图像,其潜在用途还可能覆盖影像与病理的对照研究。需要说明的是,以上为基于该集合主题与来源的通用适用方向,源站未针对具体研究场景给出明确说明。

【使用方法】

该集合托管于 IDC 平台,可通过来源站 portal.imaging.datacommons.cancer.gov 访问。源站描述中给出了 TCGA-KICH 专门页面以及 DICOM 转换的 Slide Microscopy 图像页面的链接,用户可通过这些页面了解影像详情并获取支持性元数据。关于具体的下载方式、检索接口、访问权限、是否需要申请或注册等操作细节,源站未提供。

【质量与限制】

该集合的受试者数量为 113 例,属于特定癌种的影像集合,样本规模相对有限。关于影像质量、标注完整性、数据缺失情况、版本更新记录等质量相关信息,源站未提供。使用时应结合其作为 TCGA 影像补充资源的定位,注意其覆盖范围限于肾嫌色细胞癌病例。

【引用与许可】

源站描述中提供了 TCGA-KICH 的 DOI(https://doi.org/10.7937/K9/TCIA.2016.YU3RBCZN)以及 DICOM 转换的 Slide Microscopy 图像页面的 DOI(https://doi.org/10.5281/zenodo.12690004),可用于引用与进一步查阅。关于该集合的具体许可条款、使用限制与再分发要求,源站未提供。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/explore/filters?collection_id=tcga_kich

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDC 数据集 TCGA-KICH。癌症类型:肾嫌色细胞癌。肿瘤部位:肾。受试者:113 例。癌症基因组图谱-肾嫌色细胞癌(TCGA-KICH)数据集的建立是丰富癌症基因组图谱(TCGA)https://cancergenome.nih.gov/(https://cancergenome.nih.gov/)数据集特征化放射影像这一更大规模工作的一部分。癌症影像计划(CIP)与多家 TCGA 组织贡献机构合作,已归档了经基因分析的 KICH 病例的大部分放射影像。请访问 TCGA-KICH(https://doi.org/10.7937/K9/TCIA.2016.YU3RBCZN)页面,以了解有关放射影像的更多信息并获取该数据集的支持性元数据。请访问 TCGA-KICH 数据集的 DICOM 转换幻灯片显微图像(https://doi.org/10.5281/zenodo.12690004)页面,以了解有关组织病理学图像的更多信息并获取该数据集的支持性元数据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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