卡波西肉瘤相关疱疹病毒关闭和核酸外切酶蛋白的晶体结构

该数据集是一个包含卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)关闭和核酸外切酶蛋白晶体结构的数据集,数据模态为蛋白质三维结构信息,通过X射线衍射方法在1.85 Å分辨率下解析,主要应用于结构生物学和病毒病理机制研究,为理解病毒蛋白质功能及开发抗病毒疗法提供关键结构基础。

Protein Data Bank Japan
2024-03-20 更新
浏览 22
病毒蛋白质结构解析结构生物学研究
Crystal structure of the Shutoff and Exonuclease Protein from Kaposis Sarcoma Associated Herpesvirus

基本信息

创建/更新时间
2024-03-20

资源简介

卡波西肉瘤相关疱疹病毒关闭和核酸外切酶蛋白的晶体结构

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Crystal structure of the Shutoff and Exonuclease Protein from Kaposis Sarcoma Associated Herpesvirus》。

【数据内容】

源站原始描述:ENase like PD-(D/E)XK Superfamily, Hydrolase

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.1111/j.1742-4658.2009.07374.x。

【主题与分类】

主题标签:HYDROLASE。

【获取与许可】

源站页面:https://www.rcsb.org/structure/3FHD

规范引用:Crystal structure of the shutoff and exonuclease protein from the oncogenic Kaposi''s sarcoma-associated herpesvirus (2009) Febs J

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源站:https://pdbj.org/mine/summary/3fhd

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集提供了卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)中关闭和核酸外切酶蛋白(ORF 37)的晶体结构,通过X射线衍射方法在1.85 Å分辨率下解析。数据包含蛋白质的三维原子坐标、镁离子和硫酸根离子的结合位点信息,由Dahlroth、Gurmu、Schmitzberger、Haas、Erlandsen和Nordlund等作者贡献,于2008年12月9日存入,2009年11月24日发布,并于2024年3月20日更新。该数据集主要用于结构生物学研究,帮助理解KSHV病毒的病理机制、蛋白质功能以及潜在的抗病毒药物靶点设计。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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