研究基金项目 - Pine Biotech
该数据集是一个RNA-Seq高通量测序数据集,包含从地方性和流行性卡波西肉瘤病变样本获得的转录组数据,数据模态为基因表达序列,主要用于比较分析卡波西肉瘤的转录组特征、探究HIV-1在肿瘤发病机制中的次要作用,以及支持癌症生物学和传染病领域的相关研究。

基本信息
资源简介
研究基金项目 - Pine Biotech
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Research Fellowship Project - Pine Biotech》。
【数据内容】
源站原始描述:RNA-Seq high throughput sequencing data obtained from NCBI GEO Dataset, titled ''Comparative Transcriptome Analysis of Endemic and Epidemic Kaposi’s Sarcoma (KS) Lesions and the Secondary Role of HIV-1 in KS Pathogenesis''
【主题与分类】
主题标签:Kaposi''s sarcoma transcriptome、Medicine, Health and Life Sciences。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256:e46a8064139b57680d2aa5037a25ad21649b302e6a881096a3608c19727b8283
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个公开可用的RNA-Seq高通量测序数据集,来源于NCBI GEO数据库,标题为“地方性和流行性卡波西肉瘤(KS)病变的比较转录组分析以及HIV-1在KS发病机制中的次要作用”。它包含从卡波西肉瘤病变样本获得的转录组测序数据,数据以原始或处理后的序列文件形式提供,主要用于研究卡波西肉瘤的分子机制、HIV-1感染在肿瘤发展中的角色以及相关基因表达差异,适用于癌症生物学、转录组学和传染病研究领域。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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