肝细胞重编程测序数据
该数据集包含从小鼠肝脏分离的肝细胞及多种免疫细胞（如巨噬细胞、T细胞、中性粒细胞等）的ChIP-seq测序数据，主要分析H3K27ac和STAT3的基因组占有率以及表达谱，数据模态涉及基因组和转录组层面，主要用于研究肝损伤过程中的细胞重编程机制、免疫细胞与肝细胞的相互作用，以及在肝脏疾病如肝纤维化或肝癌中的表观遗传调控与分子病理探索。
基本信息
资源简介
肝细胞重编程测序数据
【数据集背景】
源站首次发布：2023-04-27。
【数据内容】
源站原始描述：目的是分析损伤过程中免疫细胞和肝细胞的表达谱，以及肝细胞中H3K27ac和STAT3的基因组占有率。（2）分组：巨噬细胞、T细胞、中性粒细胞、单核细胞、肝细胞、LPLC、成肝细胞（3）从正常日粮喂养和DDC日粮喂养的小鼠肝脏中灌注和分离肝细胞，基于ChIP-seq 分析H3K27ac或STAT3的基因组占有率。
【主题与分类】
主题标签：肝损伤、肝细胞重编程、liver repair、hepatocyte reprogrammig、Mus musculus、肝脏、liver macrophage、liver hepatoblast cells、Mouse liver cell、genomic。
【获取与许可】
源站页面：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=6449de10f45ac97dd8ad04d1
使用许可：CC BY 4.0。
规范引用：35786.11.5556b6351a584f018b744daa257a008e
下载信息
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数据集获取
源站：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=6449de10f45ac97dd8ad04d1
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个用于研究肝细胞损伤与重编程机制的多组学数据集。数据集通过从小鼠肝脏中分离肝细胞及免疫细胞（包括巨噬细胞、T细胞、中性粒细胞、单核细胞、LPLC和成肝细胞），利用ChIP-seq技术分析H3K27ac和STAT3的基因组占有率，并结合表达谱数据，旨在揭示损伤过程中免疫细胞与肝细胞的相互作用以及肝细胞表观遗传调控的动态变化。数据来源于正常日粮和DDC日粮喂养的小鼠模型，主要应用于肝脏疾病（如肝纤维化、肝癌）的分子机制研究、细胞重编程探索以及免疫微环境分析。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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