基于单细胞RNA测序的毛细胞白血病解卷积研究：揭示新疾病驱动因素并鉴定DUSP1为潜在治疗靶点
该数据集是一个基于微孔板BD Rhapsody平台的单细胞RNA测序数据集，包含毛细胞白血病患者的细胞转录组数据，数据模态为单细胞基因表达矩阵，并整合了从原始计数到下游分析的完整流程，主要用于研究毛细胞白血病的细胞异质性、识别新的疾病驱动基因（如DUSP1）以及探索潜在的治疗靶点，为血液肿瘤的精准医疗提供数据支持。
基本信息
资源简介
基于单细胞RNA测序的毛细胞白血病解卷积研究：揭示新疾病驱动因素并鉴定DUSP1为潜在治疗靶点
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Single-cell RNA-Seq-based deconvolution of hairy cell leukemia reveals novel disease drivers and identifies DUSP1 as potential therapeutic target》。源站首次发布：2023-12-05。
【数据内容】
源站原始描述：Microwell-based (BD Rhapsody) scRNA-seq of Hairy Cell Leukemia Patients published in Single-cell RNA-Seq-based deconvolution of hairy cell leukemia reveals novel disease drivers and identifies DUSP1 as potential therapeutic target, Jan-Paul Bohn et al. Submitted. The files will be made available upon publication. Description of the files 01_raw_counts: count matrices as CSV as generated by the BD Rhapsody WTA analysis pipeline 10_prepare_adata : Load BD Rhapsody WTA analysis pipeline outputs int…
【数据结构与技术规格】
文件数 8 个，合计 3.13 GB。数据集 DOI：10.5281/zenodo.10262913。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/10262913
使用许可：cc-by-4.0。
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-02-07，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.10262913
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数据说明
该数据集是一个单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，聚焦于毛细胞白血病（Hairy Cell Leukemia, HCL）患者样本。数据采用微孔板（BD Rhapsody）平台生成，包含原始计数矩阵、预处理后的AnnData对象、质量控制结果、批次效应校正（scVI模型）、细胞类型注释、亚群分析以及差异基因表达（DESeq2）和通路分析结果。数据集通过系统性的生物信息学流程构建，旨在从单细胞水平解析HCL的细胞异质性、识别新的疾病驱动基因，并探索DUSP1等潜在治疗靶点。主要应用于血液肿瘤研究、单细胞转录组学方法开发以及精准医疗中的靶点发现。
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