人类健康肾脏、慢性肾病及移植排斥反应的单细胞图谱
该数据集是一个基于单细胞RNA测序技术构建的人类肾脏细胞转录组图谱，其模态为单细胞基因表达数据，包含来自健康供者、慢性肾脏病患者以及发生移植排斥反应患者的共计超过21万个肾脏细胞的基因表达谱。数据集主要用于研究肾脏在生理和病理状态下的细胞组成、基因表达差异、疾病相关细胞亚群的特征，为深入理解慢性肾脏病和移植排斥的分子机制、发现新的诊断标志物和潜在治疗靶点提供重要的数据资源。
基本信息
资源简介
人类健康肾脏、慢性肾病及移植排斥反应的单细胞图谱
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Single-cell atlas of human kidneys in health, chronic kidney disease and transplant rejection》。源站首次发布：2023-01-25。
【数据内容】
源站原始描述：This single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) dataset comprises two files: an RData file ( combined_data.RData ), which can be loaded into RStudio to generate a Seurat object, and an h5ad object ( annotated_combined_adata_full.h5ad ) for downstream analysis in Scanpy or cellxgene. The dataset contains previously published data and five new samples derived from kidney allografts undergoing graft nephrectomies. Overall, 217,411 human kidney cells are included, including 151,038 ‘control’…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 6.26 GB。数据集 DOI：10.5281/zenodo.7566982。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/7566982
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-07-01，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.7566981
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数据说明
该数据集是一个单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，包含人类肾脏在健康状态、慢性肾脏病以及移植排斥反应中的细胞转录组信息。数据集包含两个文件格式：RData文件（combined_data.RData）可用于在RStudio中生成Seurat对象，以及h5ad文件（annotated_combined_adata_full.h5ad）用于在Scanpy或cellxgene中进行下游分析。数据整合了已发表的公开数据和五个来自移植肾切除的新样本，总计包含217,411个人类肾脏细胞，其中151,038个为来自活体供者活检或肿瘤肾切除非肿瘤区域的“对照”细胞，66,373个为来自慢性肾脏病和不同病因移植排斥反应的疾病样本细胞。该数据集主要用于研究肾脏疾病的细胞异质性、疾病机制、细胞类型特异性表达变化，以及探索慢性肾脏病和移植排斥反应的生物标志物和治疗靶点。
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