人类健康肾脏、慢性肾病及移植排斥反应的单细胞图谱
该数据集是一个基于单细胞RNA测序技术构建的人类肾脏细胞转录组图谱，其模态为单细胞基因表达数据，包含来自健康供者、慢性肾脏病患者以及发生移植排斥反应患者的共计超过21万个肾脏细胞的基因表达谱。数据集主要用于研究肾脏在生理和病理状态下的细胞组成、基因表达差异、疾病相关细胞亚群的特征，为深入理解慢性肾脏病和移植排斥的分子机制、发现新的诊断标志物和潜在治疗靶点提供重要的数据资源。
创建时间2023-01-25
更新时间2025-07-01
资源简介
该数据集是一个单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，包含人类肾脏在健康状态、慢性肾脏病以及移植排斥反应中的细胞转录组信息。数据集包含两个文件格式：RData文件（combined_data.RData）可用于在RStudio中生成Seurat对象，以及h5ad文件（annotated_combined_adata_full.h5ad）用于在Scanpy或cellxgene中进行下游分析。数据整合了已发表的公开数据和五个来自移植肾切除的新样本，总计包含217,411个人类肾脏细胞，其中151,038个为来自活体供者活检或肿瘤肾切除非肿瘤区域的“对照”细胞，66,373个为来自慢性肾脏病和不同病因移植排斥反应的疾病样本细胞。该数据集主要用于研究肾脏疾病的细胞异质性、疾病机制、细胞类型特异性表达变化，以及探索慢性肾脏病和移植排斥反应的生物标志物和治疗靶点。
提供机构：Zenodo
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