与扁平苔藓及口腔扁平苔藓相比的独特免疫学特征数据集
该数据集是一个单细胞转录组学数据集,包含通过Illumina平台测序获得的基因表达和细胞多路复用数据,数据模态涉及单细胞RNA测序和分子标识符,主要用于研究扁平苔藓和口腔扁平苔藓的免疫学特征、分析免疫细胞亚群以及探索自身免疫性皮肤病的分子机制与潜在治疗靶点。

基本信息
资源简介
与扁平苔藓及口腔扁平苔藓相比的独特免疫学特征数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Distinct Immunological Features Compared to Lichen Planus and Oral Lichen Planus》。源站首次发布:2024-10-17。
【数据内容】
源站原始描述:Single Cell 3'' libraries were prepared using standard Illumina paired-end constructs, which include the P5 and P7 adaptors. The libraries incorporated a 16 bp 10x Barcode and a 12 bp Unique Molecular Identifier (UMI) within Read 1. The cDNA fragments in the 3'' Gene Expression libraries were sequenced using Read 2, while the DNA from Cell Multiplexing Oligo Feature Barcodes in the Cell Multiplexing libraries was sequenced using Read 2N. The libraries were subjected to paired-end sequencing on an…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 881.91 MB。数据集 DOI:10.17632/dzszp4pbc7.2。
【获取与许可】
源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/dzszp4pbc7
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://data.mendeley.com/datasets/dzszp4pbc7
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个单细胞转录组测序数据集,旨在研究扁平苔藓和口腔扁平苔藓的免疫学特征。数据包含通过Illumina平台测序获得的单细胞3’'基因表达文库和细胞多路复用文库,其中基因表达文库使用TruSeq引物进行测序,细胞多路复用文库使用Nextera引物进行测序,并包含10x Barcode和唯一分子标识符(UMI)。数据来源于公开的医学研究,主要用于自身免疫性皮肤病的分子机制研究、免疫细胞亚群分析以及潜在生物标志物发现。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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