结构连接矩阵

63名胶质瘤患者的脑结构连接矩阵,基于扩散MRI数据生成,用于脑网络与术后预测研究。

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DataCite Commons
2025-04-01 更新
浏览 22
医学影像Structural connectivityGlioma patients
Structural Connectivity Matrices

基本信息

模态
医学影像
大小
0.013346928 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2025-04-01
版本
v1

资源简介

结构连接矩阵

【一句话概览】

本数据集为63名胶质瘤患者的结构连接矩阵,使用SLANT分割得到的ROI,并以SIFT2加权。从胶质瘤患者扩散加权MRI数据生成这些矩阵的代码可在GitHub获取。文件数126,合计大小13.3 MB。标签为结构连接、胶质瘤患者,分类为计算神经科学(含数学神经科学与理论神经科学),许可为CC BY 4.0(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Structural connectivity matrices》。项目资助方:ZonMW - Gepersonaliseerd zorgpad voor patiënten met hersentumor - 10070012010006。源站首次发布:2024-12-11。

【数据内容】

源站原始描述:Structural connectivity matrices of 63 glioma patients, using ROIs derived from SLANT segmentation ( and weighted using SIFT2 ( Code for generating these matrices from diffusion-weighted MRI data of glioma patients can be found on Github (

【数据结构与技术规格】

文件数 126 个,合计 13.35 MB。1_structural_matrix_post.npy:undefined,105.93 KB。1_structural_matrix_pre.npy:application/octet-stream,105.93 KB。2_structural_matrix_post.npy:undefined,105.93 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.28000559.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Computational neuroscience (incl. mathematical neuroscience and theoretical neuroscience)。主题标签:Structural connectivity、Glioma patients。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Structural_connectivity_matrices/28000559

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Smolders, Lars (2024). Structural connectivity matrices. figshare. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

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curl -L -o "1_structural_matrix_pre.npy" "https://ndownloader.figshare.com/files/51084137"
curl -L -o "2_structural_matrix_post.npy" "https://ndownloader.figshare.com/files/51084149"
curl -L -o "2_structural_matrix_pre.npy" "https://ndownloader.figshare.com/files/51084140"
curl -L -o "3_structural_matrix_post.npy" "https://ndownloader.figshare.com/files/51084143"
curl -L -o "3_structural_matrix_pre.npy" "https://ndownloader.figshare.com/files/51084146"
curl -L -o "4_structural_matrix_post.npy" "https://ndownloader.figshare.com/files/51084152"
curl -L -o "4_structural_matrix_pre.npy" "https://ndownloader.figshare.com/files/51084158"

文件清单

  • 1_structural_matrix_post.npy(105.93 KB)
  • 1_structural_matrix_pre.npy(105.93 KB)
  • 2_structural_matrix_post.npy(105.93 KB)
  • 2_structural_matrix_pre.npy(105.93 KB)
  • 3_structural_matrix_post.npy(105.93 KB)
  • 3_structural_matrix_pre.npy(105.93 KB)
  • 4_structural_matrix_post.npy(105.93 KB)
  • 4_structural_matrix_pre.npy(105.93 KB)
  • 5_structural_matrix_post.npy(105.93 KB)
  • 5_structural_matrix_pre.npy(105.93 KB)
  • 6_structural_matrix_post.npy(105.93 KB)
  • 6_structural_matrix_pre.npy(105.93 KB)
  • 7_structural_matrix_post.npy(105.93 KB)
  • 7_structural_matrix_pre.npy(105.93 KB)
  • 8_structural_matrix_post.npy(105.93 KB)
  • 8_structural_matrix_pre.npy(105.93 KB)
  • 9_structural_matrix_post.npy(105.93 KB)
  • 9_structural_matrix_pre.npy(105.93 KB)
  • 10_structural_matrix_post.npy(105.93 KB)
  • 10_structural_matrix_pre.npy(105.93 KB)

文件总体积 13.35 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

Structural connectivity matrices of 63 glioma patients, using ROIs derived from SLANT segmentation (https://github.com/MASILab/SLANTbrainSeg) and weighted using SIFT2 (https://github.com/MRtrix3/mrtrix3).
Code for generating these matrices from diffusion-weighted MRI data of glioma patients can be found on Github (https://github.com/larssmolders/predicting-postop-impairment)

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.28000559.v1(source: https://figshare.com/articles/dataset/Structural_connectivity_matrices/28000559)。

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