IDH突变胶质瘤CODEX数据集
该数据集包含IDH突变胶质瘤的CODEX空间分析数据,涵盖多模态内容如平均表达矩阵、Nimbus评分、细胞表元数据以及组织与细胞分割掩模,主要用于研究低级别和高级别胶质瘤的空间组织演化、肿瘤微环境异质性及细胞相互作用,支持神经肿瘤学和空间生物学领域的定量分析。

基本信息
资源简介
IDH突变胶质瘤CODEX数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《IDH-mut glioma CODEX dataset》。源站首次发布:2026-01-26。
【数据内容】
源站原始描述:This resource provides processed CODEX data used in Hoefflin, Greenwald, Galili Darnell, Mount, et al. "Spatial analysis reveals the evolving organization of low-grade and high-grade IDH-mutant glioma". It contains Matrices for mean expression and Nimbus scores from CODEX data and Cells tables including metadata QuPath project including all tissue and cell segmentation masks Imaging data ist publicly available at: 10.6019/S-BIAD2840 Code is publicly available at
【数据结构与技术规格】
文件数 10 个,合计 5.72 GB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.18378034。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/records/18378034
使用许可:cc-by-4.0。
【使用注意】
· 源站最后修改于 2026-02-01,引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取(Zenodo 公开直链)
源站:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.18378034
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数据说明
该数据集提供了经过处理的CODEX(共检测索引)空间分析数据,源自Hoefflin, Greenwald, Galili Darnell, Mount等人的研究《空间分析揭示低级别和高级别IDH突变胶质瘤的演化组织》。数据集包含:CODEX数据的平均表达矩阵和Nimbus评分矩阵、包含元数据的细胞表、以及包含所有组织和细胞分割掩模的QuPath项目。成像数据公开于10.6019/S-BIAD2840,相关代码可在https://github.com/tiroshlab/spatial_IDHm获取。该数据集主要用于支持胶质瘤(特别是IDH突变亚型)的空间生物学研究,探索肿瘤微环境、细胞异质性及组织演化模式。
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