GL261胶质母细胞瘤空间转录组学数据集

该数据集提供了GL261胶质母细胞瘤小鼠模型的冠状脑切片空间转录组学数据,数据模态包括基因表达的空间信息;通过10x Genomics Visium平台获取,并进行了质量控制、区域识别、差异表达和细胞类型反卷积分析,主要用于研究胶质母细胞瘤的肿瘤微环境空间特征、验证临床前模型以及支持肿瘤生物学和空间转录组学方法的发展。

Zenodo
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2026-05-28 更新
胶质母细胞瘤空间转录组肿瘤微环境图谱
创建时间2026-05-28
更新时间2026-05-28
原始链接

https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.20425356

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资源简介

该数据集是基于GL261同基因小鼠模型的空间转录组学数据,该模型是胶质母细胞瘤研究中最广泛使用的临床前模型。数据集包含一个对照组和两个GL261肿瘤负荷小鼠在植入后两周的冠状脑切片,使用10x Genomics Visium空间基因表达平台获取。数据经过质量控制和解剖注释,识别了空间区域,进行了差异表达和通路富集分析,并利用三个独立的单细胞RNA-seq参考进行了细胞类型反卷积。该空间图谱为在这一广泛使用的模型中解释临床前研究提供了框架。主要研究方向包括胶质母细胞瘤的肿瘤微环境、空间转录组学分析以及临床前模型验证。

提供机构:Zenodo

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