GL261胶质母细胞瘤空间转录组学数据集
该数据集提供了GL261胶质母细胞瘤小鼠模型的冠状脑切片空间转录组学数据，数据模态包括基因表达的空间信息；通过10x Genomics Visium平台获取，并进行了质量控制、区域识别、差异表达和细胞类型反卷积分析，主要用于研究胶质母细胞瘤的肿瘤微环境空间特征、验证临床前模型以及支持肿瘤生物学和空间转录组学方法的发展。
基本信息
资源简介
GL261胶质母细胞瘤空间转录组学数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Spatial Transcriptomics of the GL261 Glioblastoma》。源站首次发布：2026-05-28。
【数据内容】
源站原始描述：Summary The GL261 syngeneic mouse model is the most widely used preclinical model for glioblastoma research, yet comprehensive spatial transcriptomic characterization of its tumor microenvironment is lacking. We performed 10x Genomics Visium spatial transcriptomics on coronal brain sections from one control and two GL261 tumor-bearing C57BL/6J mice at two weeks post-implantation. Following quality control and anatomical annotation, we identified spatial domains, performed differential expression…
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI：10.5281/zenodo.20425356。
【主题与分类】
主题标签：mouse、glioblastoma、GL261、spatial transcriptomics、Visium、Seurat、RCTD、GSEA。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/20425356
使用许可：cc-by-4.0。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.20425356
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数据说明
该数据集是基于GL261同基因小鼠模型的空间转录组学数据，该模型是胶质母细胞瘤研究中最广泛使用的临床前模型。数据集包含一个对照组和两个GL261肿瘤负荷小鼠在植入后两周的冠状脑切片，使用10x Genomics Visium空间基因表达平台获取。数据经过质量控制和解剖注释，识别了空间区域，进行了差异表达和通路富集分析，并利用三个独立的单细胞RNA-seq参考进行了细胞类型反卷积。该空间图谱为在这一广泛使用的模型中解释临床前研究提供了框架。主要研究方向包括胶质母细胞瘤的肿瘤微环境、空间转录组学分析以及临床前模型验证。
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