人类胶质母细胞瘤数据集

该数据集包含来自57岁男性捐赠者的多形性胶质母细胞瘤细胞样本,涵盖细胞级别的生物医学数据,可能涉及基因表达、蛋白质组学或细胞形态学等多模态信息,主要用于脑肿瘤的生物医学研究,包括胶质母细胞瘤的病理机制探索、生物标志物鉴定以及潜在治疗靶点的发现。

ReminhoReminho
kaggle
2020-11-26 更新
浏览 15
earth and naturecancerhealthbiology
Human Glioblastoma Dataset

基本信息

大小
0.02 GB
许可
Attribution 4.0 International (CC BY 4.0)
创建/更新时间
2020-11-26
版本
v2

资源简介

人类胶质母细胞瘤数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Human Glioblastoma Dataset》。源站首次发布:2020-11-26。

【数据内容】

源站原始描述:### Context This dataset is for those who are interested in dimensionality reduction techniques such as principle component analysis (PCA) or non-linear techniques like t-distributed stochastic neighbor embedding (tSNE) and Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP). ### Content This dataset contains single-cell RNA sequencing (scRNAseq) gene expression count data from a population of glioblastoma cells of a human male donor age 57. Glioblatoma is the most aggressive type of cancer whi…

【数据结构与技术规格】

文件数 3 个,合计 20.57 MB。

【主题与分类】

主题标签:earth and nature、cancer、health、biology。

【获取与许可】

源站页面:https://www.kaggle.com/datasets/reminho/human-glioblastoma-dataset

使用许可:Attribution 4.0 International (CC BY 4.0)。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

方式一:KaggleHub(Python,推荐 AI Agent 使用)

# 前置依赖: pip install kagglehub
import kagglehub

path = kagglehub.dataset_download("reminho/human-glioblastoma-dataset")
print("数据已下载至:", path)

方式二:Kaggle CLI(命令行)

# 前置条件: 注册 Kaggle 账号, Settings > API > Create New Token
# 将 kaggle.json 放到 ~/.kaggle/ 并 chmod 600
pip install kaggle
kaggle datasets download -d reminho/human-glioblastoma-dataset
unzip human-glioblastoma-dataset.zip -d human-glioblastoma-dataset/

数据说明

该数据集包含来自一名57岁男性捐赠者的多形性胶质母细胞瘤细胞样本,主要用于脑肿瘤的生物医学研究。数据集包含细胞级别的生物医学数据,可能涉及基因表达、蛋白质组学或细胞形态学特征等多模态信息。数据来源于临床捐赠样本,通过标准化实验流程采集和构建,适用于胶质母细胞瘤的病理机制研究、生物标志物发现以及药物靶点探索等研究方向。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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