胃肠道间质瘤中长基因间非编码RNA失调的识别
该数据集包含15名胃肠道间质瘤（GIST）患者的配对肿瘤与正常组织的下一代测序数据，数据模态为基因表达谱（RNA测序），主要用于识别在GIST中失调的长基因间非编码RNA（lincRNAs），如MALAT1、H19和FENDRR，并探索其与致癌基因ETV1和miR-455-3p的关联，以支持癌症生物学和非编码RNA在GIST发病机制中的功能研究。
创建时间2018-12-17
更新时间2018-12-17
原始链接
https://figshare.com/articles/dataset/Identification_of_long_intergenic_non-coding_RNAs_lincRNAs_deregulated_in_gastrointestinal_stromal_tumors_GISTs_/7474403
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资源简介
该数据集是一个专注于胃肠道间质瘤（GIST）分子机制的生物医学数据集，旨在识别在GIST中失调的长基因间非编码RNA（lincRNAs）。数据集包含来自15名患者的配对GIST组织和邻近正常组织的下一代测序数据，通过基于网络的lincRNA分析，鉴定出三个显著失调的lincRNAs（MALAT1、H19和FENDRR），并在验证队列中确认了H19和FENDRR的上调。研究还揭示了H19与GIST相关致癌基因ETV1以及miR-455-3p之间的潜在关联。数据来源于患者样本测序，主要应用于癌症生物学、非编码RNA功能研究和GIST致癌机制探索，为未来功能研究提供了重要资源。
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