SDH缺陷型GIST表观基因组数据集
包含GIST患者样本、异种移植和细胞系的RNA-seq、甲基化、CTCF、Hi-C等数据。由The Hebrew University of Jerusalem提供,来自Gene Expression Omnibus,包含多种数据模态,包含100条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的胃肠道间质瘤(GIST)研究。
基本信息
模态
多模态
数据量
100
任务类型
分类
创建/更新时间
2019-12-21
资源简介
包含GIST患者样本、异种移植和细胞系的RNA-seq、甲基化、CTCF、Hi-C等数据。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE107447
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含GIST患者样本、异种移植和细胞系的RNA-seq、甲基化、CTCF、Hi-C等数据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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