儿童低级别胶质瘤与神经节胶质瘤单细胞图谱
该数据集包含儿童低级别胶质瘤和神经节胶质瘤样本的单细胞转录组数据，用于分析BRAF相关肿瘤微环境。由Pediatric Neuro-oncology Cell Atlas提供，来自Pediatric Neuro-oncology Cell Atlas，数据格式为表格，包含23条数据记录，适用于分类任务，许可证为CC BY 4.0。
基本信息
资源简介
儿童低级别胶质瘤与神经节胶质瘤单细胞图谱
【一句话概览】
儿童低级别胶质瘤占全部脑肿瘤的35%，患者虽生存良好，但疾病和治疗带来显著负担。研究采用单细胞RNA测序、空间转录组学和细胞因子分析，刻画毛细胞型星形细胞瘤与节细胞胶质瘤的肿瘤及免疫细胞异质性。肿瘤细胞含祖细胞和成熟细胞亚群，免疫细胞包括髓系和淋巴细胞，两种肿瘤的髓系亚群比例存在差异。KIAA1549-BRAF肿瘤比BRAF V600E肿瘤更具免疫原性，分泌更多免疫激活因子和趋化因子。多维度分析揭示了两种肿瘤微环境的复杂性及遗传驱动差异（来源 pneuroonccellatlas.org）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Multi-pronged analysis of pediatric low-grade glioma and ganglioglioma reveals a unique tumor microenvironment associated with BRAF alterations》。
【数据内容】
源站原始描述：Pediatric low-grade gliomas (pLGG) comprise 35% of all brain tumors. Despite favorable survival, patients experience significant morbidity from disease and treatments. A deeper understanding of pLGG biology is essential to identify novel, more effective, and less toxic therapies. We utilized single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), spatial transcriptomics, and cytokine analyses to characterize and understand tumor and immune cell heterogeneity of pilocytic astrocytoma (PA) and ganglioglioma (GG).…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：儿童低级别胶质瘤（pLGG）占所有脑肿瘤的35%。尽管生存率良好，但患者因疾病和治疗而承受着显著的发病率负担。深入理解pLGG的生物学特性对于识别新型、更有效且毒性更低的疗法至关重要。我们利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学和细胞因子分析来表征和理解毛细胞型星形细胞瘤（PA）和神经节胶质瘤（GG）的肿瘤及免疫细胞异质性。scRNA-seq揭示了肿瘤微环境（TME）中的肿瘤细胞和免疫细胞。肿瘤细胞亚群包括祖细胞和成熟细胞群体。免疫细胞包括髓系和淋巴细胞。PA和GG之间两个主要髓系亚群的患病率存在显著差异。批量和单细胞细胞因子分析评估了免疫细胞信号级联，肿瘤样本间存在不同的免疫表型。与BRAF V600E肿瘤相比，KIAA1549-BRAF肿瘤似乎更具免疫原性，分泌更高水平的免疫细胞激活剂和趋化因子。空间转录组学揭示了这些趋化因子的差异基因表达及其在TME中的位置。多管齐下的分析展示了PA和GG TME的复杂性，以及可能影响免疫治疗反应的遗传驱动因素之间的差异。有必要进一步研究免疫细胞浸润和肿瘤-免疫相互作用。
【主题与分类】
主题标签：pediatric low-grade glioma、ganglioglioma、pilocytic astrocytoma、BRAF、scRNA-sequencing、spatial transcriptomics、tumor microenvironment。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.pneuroonccellatlas.org/publication/zahedi-2025-id/
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://www.pneuroonccellatlas.org/publication/zahedi-2025-id/
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含儿童低级别胶质瘤和神经节胶质瘤样本的单细胞转录组数据，用于分析BRAF相关肿瘤微环境。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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