C11orf95-RELA融合通过独特表观遗传调控驱动异常基因表达形成室管膜瘤的补充文件10

资源简介

C11orf95-RELA融合通过独特表观遗传调控驱动异常基因表达形成室管膜瘤的补充文件10

Additional file 10 of C11orf95-RELA fusion drives aberrant gene expression through the unique epigenetic regulation for ependymoma formation

该数据集为研究论文的补充文件10，以XLSX格式提供室管膜瘤相关表观遗传与转录调控数据。内容涵盖H1203-mEPN细胞中RELAFUS1-HA在TSS±10kb的峰列表（649个峰、520个基因）、H41与H1203-mEPN细胞的H3K27ac峰列表、两细胞系中鉴定的超级增强子及其重叠列表，以及ST-室管膜瘤单细胞转录组特征基因与RELAFUS1靶基因的重叠基因列表。数据可用于分析融合蛋白靶基因、增强子重编程及室管膜瘤形成机制（来源 figshare，CC BY + CC0 许可）。

【数据集背景】

配套论文《Toward controlling gene expression at will: Specific regulation of the

erbB

2

/

HER

2

promoter by using polydactyl zinc finger proteins constructed from modular building blocks》发表于 Proceedings of the National Academy of Sciences（1998），DOI：10.1073/pnas.95.25.14628。项目资助方：KAKENHI Children’s Cancer Association of Japan The Mother and Child Health Foundation JST CREST JSPS Grant-in-Aid for Scientific Research The Takeda Science Foundation。源站首次发布：2021-05-18。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：补充文件10：表S2。(A) H1203-mEPN细胞中TSS±10kb范围内RELAFUS1-HA峰列表（649个峰；520个基因）。(B) H41-mEPN细胞中H3K27ac峰列表。(C) H1203-mEPN细胞中H3K27ac峰列表。(D和E) mEPN细胞H3K27ac峰中鉴定的超级增强子（SEs）列表（D为H41细胞，E为H1203细胞）。(F) H41和H1203-mEPN细胞中超级增强子（SEs）重叠列表。(G) ST-室管膜瘤单细胞转录组特征基因与293T-RELAFUS1或小鼠室管膜瘤（H1203）细胞中RELAFUS1靶基因之间的重叠基因列表。(XLSX 5761 KB)

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个，合计 5.90 MB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.14183612.v2。

【主题与分类】

源站学科分类：Genetics。主题标签：Ependymoma、Fusion gene、NF-κB signaling、Transcription factor motif。本站分类：肿瘤/室管膜瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Genetics。

【获取与许可】

源站页面：https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_10_of_C11orf95-RELA_fusion_drives_aberrant_gene_expression_through_the_unique_epigenetic_regulation_for_ependymoma_formation/14183612

使用许可：CC BY + CC0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。

规范引用：Ozawa, Tatsuya; Kaneko, Syuzo; Szulzewsky, Frank; Qiao, Zhiwei; Takadera, Mutsumi; Narita, Yoshitaka; et al. (2021). Additional file 10 of C11orf95-RELA fusion drives aberrant gene expression through the unique epigenetic regulation for ependymoma formation. figshare. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-02，引用时请注意版本时效。