HE-VS-MPM乳腺DCISM病理影像数据集

包含导管原位癌伴微浸润病例的H&E病理图像、CK5/6免疫组化图像及多光子显微成像数据,可用于病理图像分类与分析。由The Cancer Imaging Archive提供,来自The Cancer Imaging Archive,包含12条数据记录,许可证为CC BY 4.0,专注于肿瘤领域的导管原位癌(DCIS)研究。

The Cancer Imaging ArchiveThe Cancer Imaging Archive
The Cancer Imaging Archive
2023-12-08 更新
浏览 28
图像分类Breast Cancer
HE-VS-MPM

基本信息

模态
图像
大小
3.7 GB
数据量
12
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-12-08
版本
Complete

资源简介

HE-VS-MPM乳腺DCISM病理影像数据集

【一句话概览】

本数据集是 TCIA 公开的影像数据集,收录 合计 43.00 GB、12 例受试者,主题涵盖 Breast Cancer,可用于医学图像分割、检测与分类模型的训练与评测,CC BY 4.0 许可开放获取。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Multimodal imaging of ductal carcinoma in situ with microinvasion》。源站首次发布:2023/12/08。

【数据内容】

源站原始描述:Ductal carcinoma in situ with microinvasion (DCISM) is a challenging subtype of breast cancer with controversial invasiveness and prognosis. Accurate diagnosis of DCISM from ductal carcinoma in situ (DCIS) is crucial for optimal treatment and improved clinical outcomes. This dataset provides histopathology images and paired CK5/6 immunohistochemical staining images from patients with DCISM, as well as multiphoton microscopy images of suspicious regions. It offers multi-modal imaging data from va…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):导管原位癌伴微浸润(DCISM)是一种具有挑战性的乳腺癌亚型,其侵袭性和预后仍存在争议。准确地将DCISM与导管原位癌(DCIS)鉴别诊断,对于优化治疗和改善临床结局至关重要。该数据集提供了DCISM患者的组织病理学图像和配对的CK5/6免疫组化染色图像,以及可疑区域的多光子显微镜图像。它为领域内其他研究人员分析和诊断微浸润性乳腺癌提供了多视角的多模态影像数据。

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.7937/3fyc-ac78。

【主题与分类】

源站学科分类:Histopathology、Whole Slide Image、Multiphoton。主题标签:Breast Cancer。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.cancerimagingarchive.net/collection/he-vs-mpm/

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Han, X., Liu, Y., Chen, J., & Kang, D. (2023). Multimodal imaging of ductal carcinoma in situ with microinvasion (HE-vs-MPM) (Version 1) [Data set]. The Cancer Imaging Archive

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(TCIA 标准方式)

方式一:NBIA 搜索

  1. 打开 NBIA 搜索页(免费注册 TCIA 账号);
  2. 按本数据集 Collection 名称筛选(见源站页面),加入 Download Basket;
  3. 用 NBIA Download Manager 批量下载 DICOM。

方式二:NBIA API(程序化)

curl -s "https://services.cancerimagingarchive.net/nbia-api/services/v1/getSeries?Collection=COLLECTION_NAME" -o series.json

方式三:TCIA Manifest + dicomsort

在 Collection 页面下载 .tcia manifest 文件后用 NBIA CLI 下载。

数据集大小约 3.70 GB。

数据说明

包含导管原位癌伴微浸润病例的H&E病理图像、CK5/6免疫组化图像及多光子显微成像数据,可用于病理图像分类与分析。

数据加载示例(DICOM 影像)

import pydicom, glob, os
files = glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.dcm"), recursive=True)
d = pydicom.dcmread(files[0])
print("Modality:", d.Modality)
img = d.pixel_array

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