乳腺癌筛查数字乳腺断层合成数据集

BCS-DBT包含数字乳腺断层合成影像,含正常、可疑、活检证实良性和癌症病例,适合乳腺癌筛查检测研究。由Duke University提供,来自The Cancer Imaging Archive,包含医学影像数据,包含5060条数据记录,适用于目标检测任务,许可证为CC BY 4.0,专注于肿瘤领域的导管原位癌(DCIS)研究。

Duke UniversityDuke University
The Cancer Imaging Archive
2021-01-01 更新
浏览 35
图像目标检测Breast CancerNon-Cancer
Breast Cancer Screening DBT

基本信息

模态
图像
大小
685 GB
数据量
5060
任务类型
目标检测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2021-01-01
版本
Complete

资源简介

乳腺癌筛查数字乳腺断层合成数据集

【一句话概览】

本数据集是 TCIA 公开的影像数据集,收录 合计 1630.00 GB、5060 例受试者,主题涵盖 Breast Cancer、Non-Cancer,可用于医学图像分割、检测与分类模型的训练与评测,https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ 许可开放获取。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Breast Cancer Screening - Digital Breast Tomosynthesis》。源站首次发布:2024/01/18。

【数据内容】

源站原始描述:The DBTex lesion detection challenge tasked participating teams with detecting lesions in the BCS-DBT test set. The challenge had two phases: DBTex1 and DBTex2 . Here we provide the BCS-DBT lesion predictions made by all participating teams for both phases, for both the BCS-DBT test and validation sets, as “team_predictions_bothphases.zip”. Please see here under “ Output format for the DBTex2 Challenge test set results ” for a description of how these results are formatted. Finally, when compari…

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.7937/E4WT-CD02。

【主题与分类】

源站学科分类:MG、Classification、Radiomic Feature、Measurement、Other。主题标签:Breast Cancer、Non-Cancer。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.cancerimagingarchive.net/collection/breast-cancer-screening-dbt/

使用许可:https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/(https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/)。

规范引用:Buda, M., Saha, A., Walsh, R., Ghate, S., Li, N., Swiecicki, A., Lo, J. Y., Yang, J., & Mazurowski, M. (2020). Breast Cancer Screening – Digital Breast Tomosynthesis (BCS-DBT) (Version 5) [dataset]. The Cancer Imaging Archive

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(TCIA 标准方式)

方式一:NBIA 搜索

  1. 打开 NBIA 搜索页(免费注册 TCIA 账号);
  2. 按本数据集 Collection 名称筛选(见源站页面),加入 Download Basket;
  3. 用 NBIA Download Manager 批量下载 DICOM。

方式二:NBIA API(程序化)

curl -s "https://services.cancerimagingarchive.net/nbia-api/services/v1/getSeries?Collection=COLLECTION_NAME" -o series.json

方式三:TCIA Manifest + dicomsort

在 Collection 页面下载 .tcia manifest 文件后用 NBIA CLI 下载。

数据集大小约 685.00 GB。

数据说明

BCS-DBT包含数字乳腺断层合成影像,含正常、可疑、活检证实良性和癌症病例,适合乳腺癌筛查检测研究。

数据加载示例(DICOM 影像)

import pydicom, glob, os
files = glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.dcm"), recursive=True)
d = pydicom.dcmread(files[0])
print("Modality:", d.Modality)
img = d.pixel_array

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