EWS-WT1融合异构体在促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤中建立致癌程序及治疗脆弱性

促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤中EWS-WT1融合的组蛋白修饰ChIP-seq染色质谱数据。

NIAID Data Ecosystem
浏览 9
基因组促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤ChIP-seq
EWS-WT1 Fusion Isoforms Establish Oncogenic Programs and Therapeutic Vulnerabilities in Desmoplastic Small Round Cell Tumors

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-16
版本
v1.p1

资源简介

该数据集对应dbGaP研究phs003682.v1.p1,聚焦促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤(DSRCT)中由EWSR1-WT1融合驱动的致癌机制。研究使用全基因组染色质profiling(组蛋白修饰ChIP-seq)鉴定EWS-WT1依赖的基因调控网络和靶基因,并提供原发性DSRCT样本的ChIP-seq谱图。数据可用于研究融合转录因子对远端调控元件的激活、致癌基因表达程序以及治疗脆弱性。

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数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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