HuR-ELAVL1 驱动恶性外周神经鞘瘤生长与转移
HuR-ELAVL1 驱动恶性外周神经鞘瘤生长与转移。HuR-ELAVL1 驱动恶性外周神经鞘瘤生长与转移。HuR 在人 MPNST 样本中高度升高，并控制肿瘤生长与转移所必需的广泛转录组程序
基本信息
资源简介
HuR-ELAVL1 驱动恶性外周神经鞘瘤生长与转移
，是一个聚焦于恶性外周神经鞘瘤（MPNST）的基础肿瘤研究数据集。该研究识别出 RNA 结合蛋白 HuR（ELAVL1）是 MPNST 中的关键致癌驱动因子。HuR 在人类 MPNST 样本中高度升高，并控制着肿瘤生长与转移所必需的广泛转录组程序。数据集围绕这一核心发现组织，涵盖 MPNST 细胞系的 Bulk RNA-seq 与 ChIP-seq 数据，物种为 Homo sapiens，相关成果发表于 2020 年的 JCI，并提供了对应的文献标识。该数据集适合用于探索 HuR-ELAVL1 在 MPNST 中的转录调控作用及相关机制研究。
【数据集背景】
恶性外周神经鞘瘤（MPNST）是一种肿瘤类型，本数据集所属分类为肿瘤 / 其他。该研究的核心背景在于识别 HuR（ELAVL1）这一 RNA 结合蛋白在 MPNST 中的致癌作用。研究显示，HuR 在人类 MPNST 样本中高度升高，并控制着对肿瘤生长和转移至关重要的广泛转录组程序。这一发现将 HuR-ELAVL1 确立为 MPNST 的关键致癌驱动因子，为理解该肿瘤的分子机制提供了基础。数据集的英文名称即为“HuR-ELAVL1 drives malignant peripheral nerve sheath tumor growth and metastasis.”，直接点明了研究主题。
【数据内容】
数据集包含的测定类型为 Bulk RNA-seq 和 ChIP-seq。研究对象为 MPNST 细胞系，具体包括 ST88-14 和 ST88。物种为 Homo sapiens。数据内容围绕 HuR-ELAVL1 在 MPNST 中的转录组程序与结合特征展开，旨在支撑对肿瘤生长与转移相关转录组程序的分析。除上述测定类型、细胞系与物种信息外，源站未提供更细粒度的数据内容描述。
【采集与来源】
数据来源站为 synapse.org。研究机构为 CIC bioGUNE, Basque Research and Technology Alliance (BRTA)。作者包括 Marta Palomo-Irigoyen 等以及 Ashwin Woodhoo。发表信息为 2020 年发表于 JCI，PMID 为 32315290，DOI 为 10.1172/JCI130379。上述信息构成了该数据集的来源与出处依据。除这些信息外，源站未提供更详细的样本采集流程或实验操作细节。
【适用场景】
该数据集适用于与 MPNST 相关的肿瘤研究，尤其是围绕 HuR-ELAVL1 致癌驱动机制、转录组调控以及肿瘤生长与转移相关程序的分析。由于包含 Bulk RNA-seq 与 ChIP-seq 两类数据，可用于研究基因表达变化与蛋白-DNA 结合特征。研究对象为人类 MPNST 细胞系 ST88-14 和 ST88，因此适合在细胞系层面开展机制探索。除上述方向外，源站未提供其他具体适用场景的说明。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明。用户可依据数据集所包含的 Bulk RNA-seq 与 ChIP-seq 数据，结合其研究目的进行相应分析。关于数据下载、处理流程或分析工具等细节，源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量与限制的说明。该数据集基于 MPNST 细胞系 ST88-14 和 ST88，物种为 Homo sapiens，相关结论来自 2020 年发表于 JCI 的研究。除这些信息外，源站未提供其他质量评估或使用限制的内容。
【引用与许可】
引用信息包括：发表时间为 2020 年（JCI），PMID 为 32315290，DOI 为 10.1172/JCI130379，作者包括 Marta Palomo-Irigoyen 等以及 Ashwin Woodhoo，机构为 CIC bioGUNE, Basque Research and Technology Alliance (BRTA)。关于许可条款，源站未提供。
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源站：https://synapse.org/Synapse:syn74309473
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- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
HuR-ELAVL1驱动恶性外周神经鞘瘤的生长和转移。 ## HuR-ELAVL1驱动恶性外周神经鞘瘤的生长和转移。 疾病焦点： MPNST（恶性外周神经鞘瘤） 检测类型： 批量RNA测序，ChIP测序 物种： 智人 组织/细胞类型： MPNST细胞系（ST88-14，ST88） 出版物： PMID:32315290 · DOI:10.1172/JCI130379 作者： Marta Palomo-Irigoyen，…，Ashwin Woodhoo 机构： CIC bioGUNE，巴斯克研究与技术联盟（BRTA） 出版日期： 2020年（JCI） — ### 摘要 本研究确定了HuR（ELAVL1），一种RNA结合蛋白，作为MPNST中的关键致癌驱动因素。HuR在人类MPNST样本中高度升高，并控制着对肿瘤生长和转移至关重要的广泛转录组程序。抑制HuR在体外对MPNST细胞系产生有效的细胞静止和细胞毒性作用，并在体内抑制转移。 — ### 背景 恶性外周神经鞘瘤（MPNSTs）是起源于雪旺细胞谱系细胞的高度侵袭性肉瘤。
它们具有高度转移性，对化疗和放疗均耐药，且常致命。本研究表明，MPNST细胞对RNA结合蛋白HuR/ELAVL1产生了强烈的依赖性，该蛋白协调多个致癌网络的表达，使其成为一个有吸引力的治疗靶点。 — ### 数据集 | 数据集 | 类型 | 文件数 | 存储库 | |---------|------|-------|------------| | GEO_GSE120685 | 批量RNA-seq FASTQ | 18 | GSE120685 | | GEO_GSE120686 | ChIP-seq FASTQ | 40 | GSE120686 | — ### 研究详情 | 字段 | 值 | |-------|-------| | 细胞系 | ST88-14 (NF1 MPNST), ST88 | | 条件 | shRNA对照 vs. shHuR敲低 | | ChIP靶标 | H3K4me1, H3K4me3, H
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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