从脊索到脊索瘤的恶性演变轨迹及TBXT rs2305089胚系单核苷酸多态性的作用
主题标签：脊索瘤、TBXT、rs2305089、单核苷酸多态性、恶性演变、脊索、肿瘤。本数据集为肿瘤领域公开数据集，主题涵盖脊索瘤。
基本信息
资源简介
从脊索到脊索瘤的恶性演变轨迹及TBXT rs2305089胚系单核苷酸多态性的作用
GSE277707 是一个聚焦于脊索瘤发生机制与遗传易感性的肿瘤领域公开数据集，英文全称为“The malignant trajectory from the notochord to chordoma and the role of the TBXT rs2305089 germline single nucleotide polymorphism”。该数据集围绕脊索向脊索瘤恶性演变的过程展开，并关注 TBXT 基因 rs2305089 胚系单核苷酸多态性在其中可能扮演的角色。其主题标签涵盖脊索瘤、TBXT、rs2305089、单核苷酸多态性、恶性演变、脊索以及肿瘤等关键词，属于肿瘤学与脊索瘤研究方向的资源。数据集来源于 usebiotransfer.org 收录的 NCBI Gene Expression Omnibus 条目，为研究者了解脊索瘤的分子基础与遗传背景提供了一个可检索、可引用的公开数据入口。
【数据集背景】
脊索瘤是一种与胚胎期脊索残余组织相关的肿瘤，其从正常脊索向恶性病变演变的过程是理解该疾病发生机制的关键环节。GSE277707 正是围绕这一恶性演变轨迹设立的研究数据集，同时将 TBXT 基因的 rs2305089 胚系单核苷酸多态性纳入考察范围。TBXT 与脊索发育密切相关，而 rs2305089 作为胚系单核苷酸多态性，可能影响个体对脊索瘤的易感性或疾病进程。该数据集以肿瘤/脊索瘤为分类归属，主题覆盖脊索瘤、TBXT、rs2305089、单核苷酸多态性、恶性演变、脊索和肿瘤等方向，适合用于探索脊索瘤发生发展中的遗传与表达层面问题。
【数据内容】
该数据集的主题标签包括脊索瘤、TBXT、rs2305089、单核苷酸多态性、恶性演变、脊索、肿瘤。围绕这些主题，数据集关注从脊索到脊索瘤的恶性演变过程，以及 TBXT rs2305089 胚系单核苷酸多态性在这一过程中的作用。关于具体的样本数量、分组方式、检测平台、表达矩阵或变异位点注释等详细内容，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI Gene Expression Omnibus，编号为 GSE277707，并通过 usebiotransfer.org 的 GEO Finder 工具进行收录与索引。其源站描述为：“NCBI Gene Expression Omnibus, GSE277707: The malignant trajectory from the notochord to chordoma and the role of the TBXT rs2305089 germline single nucleotide polymorphism [Dataset]”，对应链接为 https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE277707/。关于样本采集地点、时间跨度、伦理审批信息及具体实验流程，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤学特别是脊索瘤相关的研究场景，可用于探讨脊索向脊索瘤恶性演变的分子轨迹，分析 TBXT 基因及 rs2305089 胚系单核苷酸多态性在脊索瘤发生中的潜在作用，也可作为脊索瘤遗传易感性与表达特征研究的公开数据资源。此外，该数据集还可用于围绕脊索瘤、TBXT、单核苷酸多态性、恶性演变等主题开展文献检索、数据复用或方法学比较。关于更具体的适用分析类型或推荐研究设计，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 usebiotransfer.org 的 GEO Finder 工具页面访问，页面地址为 https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE277707/，并可由该页面进一步关联至 NCBI Gene Expression Omnibus 中的 GSE277707 条目。关于数据下载格式、预处理步骤、分析工具或代码示例，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 NCBI Gene Expression Omnibus 收录的公开数据集，并通过 usebiotransfer.org 进行索引。关于数据质量评估、批次效应、样本量充分性、平台偏差或验证实验等具体信息，源站未提供。使用时应结合原始 GEO 条目中的元数据与实验设计进行判断。
【引用与许可】
引用该数据集时，可参考其源站描述：“NCBI Gene Expression Omnibus, GSE277707: The malignant trajectory from the notochord to chordoma and the role of the TBXT rs2305089 germline single nucleotide polymorphism [Dataset]. https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE277707/”。关于该数据集的具体许可条款、使用限制或授权要求，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE277707
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
NCBI基因表达综合数据库，GSE277707：从脊索到脊索瘤的恶性演变轨迹及TBXT rs2305089胚系单核苷酸多态性的作用[数据集]。https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE277707/
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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